99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0192 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  98.74 
 
 		 795 aa  1484    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  52.64 
 
 		 821 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  52.52 
 
 		 821 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  52.52 
 
 		 819 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  56.16 
 
 		 793 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1501    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  91.7 
 
 		 795 aa  1177    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  62.12 
 
 		 800 aa  745    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  52.33 
 
 		 820 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  52.14 
 
 		 821 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  60.97 
 
 		 802 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  56.46 
 
 		 800 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  51.53 
 
 		 821 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  51.6 
 
 		 820 aa  625  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  48.72 
 
 		 825 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  48.21 
 
 		 819 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  48.34 
 
 		 815 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  49.45 
 
 		 819 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  47.96 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  48.96 
 
 		 826 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  47.78 
 
 		 820 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  46.35 
 
 		 804 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.07 
 
 		 817 aa  311  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  31.04 
 
 		 817 aa  286  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.89 
 
 		 817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.74 
 
 		 836 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  29.53 
 
 		 836 aa  246  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.06 
 
 		 836 aa  245  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.14 
 
 		 889 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 884 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.71 
 
 		 879 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  27.62 
 
 		 889 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  28.79 
 
 		 840 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.41 
 
 		 897 aa  233  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  29.04 
 
 		 887 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  27.13 
 
 		 865 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  28.4 
 
 		 845 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.29 
 
 		 850 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  28.4 
 
 		 878 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.61 
 
 		 849 aa  211  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.03 
 
 		 887 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.13 
 
 		 889 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  29.98 
 
 		 850 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  28.59 
 
 		 855 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.73 
 
 		 849 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 839 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  30.64 
 
 		 753 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 		 847 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  29.36 
 
 		 870 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  29.36 
 
 		 866 aa  170  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 847 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  31.36 
 
 		 843 aa  159  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.29 
 
 		 813 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.51 
 
 		 929 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 		 837 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  32.95 
 
 		 846 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.37 
 
 		 858 aa  119  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  33.26 
 
 		 845 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.14 
 
 		 872 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  33.49 
 
 		 843 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.28 
 
 		 858 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  28.44 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.44 
 
 		 867 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.32 
 
 		 846 aa  98.2  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.38 
 
 		 855 aa  97.8  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 		 844 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 884 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 857 aa  92  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  29.16 
 
 		 868 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.46 
 
 		 851 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  26.92 
 
 		 853 aa  87.8  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  27.85 
 
 		 855 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  38.31 
 
 		 842 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  38.31 
 
 		 842 aa  80.9  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  38.31 
 
 		 842 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  30.41 
 
 		 877 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.71 
 
 		 850 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 877 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  28.9 
 
 		 866 aa  68.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  36.6 
 
 		 841 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 856 aa  55.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 849 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 866 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 849 aa  51.2  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.11 
 
 		 855 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.26 
 
 		 843 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 445 aa  47.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.44 
 
 		 410 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.48 
 
 		 411 aa  47.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  24.24 
 
 		 851 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  29.2 
 
 		 393 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 856 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  29.32 
 
 		 827 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 376 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.03 
 
 		 416 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.77 
 
 		 424 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>