More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2018 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  58.21 
 
 		 839 aa  860    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  43.7 
 
 		 850 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 847 aa  1664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  45.4 
 
 		 849 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  93.62 
 
 		 847 aa  1487    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  46.13 
 
 		 845 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  44.86 
 
 		 870 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  44.28 
 
 		 866 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.75 
 
 		 837 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  39.34 
 
 		 855 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  43.6 
 
 		 843 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  43.85 
 
 		 843 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  36.65 
 
 		 846 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  30.15 
 
 		 858 aa  314  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.91 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 842 aa  237  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.56 
 
 		 842 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.82 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  31.32 
 
 		 841 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 849 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 849 aa  230  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.85 
 
 		 817 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  27.06 
 
 		 858 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.8 
 
 		 817 aa  219  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.93 
 
 		 817 aa  217  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.77 
 
 		 850 aa  217  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  26.15 
 
 		 879 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.98 
 
 		 889 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  25.98 
 
 		 889 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.12 
 
 		 846 aa  204  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 884 aa  203  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 857 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 821 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  26.12 
 
 		 855 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  27.2 
 
 		 887 aa  190  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.05 
 
 		 845 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  26 
 
 		 865 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.1 
 
 		 821 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  26.83 
 
 		 887 aa  184  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 844 aa  177  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  27.04 
 
 		 857 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  26.72 
 
 		 850 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  24.43 
 
 		 878 aa  171  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.18 
 
 		 840 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  24.46 
 
 		 897 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  23.88 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.87 
 
 		 867 aa  159  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.42 
 
 		 836 aa  154  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  30.57 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 800 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.61 
 
 		 793 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.23 
 
 		 820 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  30.66 
 
 		 820 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.97 
 
 		 843 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.65 
 
 		 825 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.32 
 
 		 819 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.95 
 
 		 855 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  27.46 
 
 		 889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 852 aa  125  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.45 
 
 		 819 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 408 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.46 
 
 		 820 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 804 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.66 
 
 		 821 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 848 aa  118  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.92 
 
 		 847 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.72 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.97 
 
 		 868 aa  112  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  25.41 
 
 		 849 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  28.33 
 
 		 802 aa  108  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  24.8 
 
 		 836 aa  107  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.13 
 
 		 821 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  27.43 
 
 		 819 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.18 
 
 		 854 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.03 
 
 		 836 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 		 445 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  28.37 
 
 		 826 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.34 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  32.16 
 
 		 866 aa  100  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 861 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.15 
 
 		 841 aa  95.9  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.99 
 
 		 845 aa  94.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  29.06 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 884 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  30.33 
 
 		 853 aa  92.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 834 aa  91.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.52 
 
 		 836 aa  90.9  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  28.84 
 
 		 855 aa  90.9  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.05 
 
 		 877 aa  90.1  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 856 aa  89.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 		 877 aa  87.8  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.46 
 
 		 842 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 835 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 835 aa  87.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.38 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 845 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  19.95 
 
 		 813 aa  84  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  23.6 
 
 		 753 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 838 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.62 
 
 		 849 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>