More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3960 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  52.91 
 
 		 848 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1625    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  42.32 
 
 		 843 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  41.44 
 
 		 842 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  43.22 
 
 		 834 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  40.09 
 
 		 847 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  37.11 
 
 		 852 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  38.99 
 
 		 849 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 		 853 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  36.76 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  39.26 
 
 		 849 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  36.77 
 
 		 856 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  36.11 
 
 		 861 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  33.45 
 
 		 855 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  35.55 
 
 		 873 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  36.97 
 
 		 859 aa  360  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  38.19 
 
 		 857 aa  355  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.07 
 
 		 836 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  37.28 
 
 		 873 aa  340  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  36.48 
 
 		 853 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  34.76 
 
 		 806 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 		 866 aa  316  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 838 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  34.21 
 
 		 841 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 		 861 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.58 
 
 		 825 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.77 
 
 		 853 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  32.46 
 
 		 821 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.01 
 
 		 855 aa  253  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  33.29 
 
 		 801 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  33.53 
 
 		 839 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 846 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.72 
 
 		 859 aa  229  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  32.55 
 
 		 828 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 		 855 aa  215  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.31 
 
 		 835 aa  208  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 		 871 aa  206  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 897 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 		 878 aa  194  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.1 
 
 		 880 aa  194  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.05 
 
 		 863 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 		 930 aa  173  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  30.33 
 
 		 857 aa  170  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.54 
 
 		 852 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.16 
 
 		 851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 855 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.72 
 
 		 850 aa  162  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 846 aa  161  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 849 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.99 
 
 		 807 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25 
 
 		 854 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 		 849 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.21 
 
 		 856 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.48 
 
 		 858 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.38 
 
 		 857 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  28.46 
 
 		 841 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26 
 
 		 870 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.4 
 
 		 849 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.1 
 
 		 850 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.97 
 
 		 858 aa  125  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 828 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 822 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 847 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.82 
 
 		 866 aa  109  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  32.18 
 
 		 826 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.24 
 
 		 858 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.24 
 
 		 843 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.43 
 
 		 855 aa  102  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 884 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.28 
 
 		 850 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 822 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 847 aa  98.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 845 aa  97.8  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 		 844 aa  95.1  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  25 
 
 		 855 aa  93.2  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.83 
 
 		 829 aa  90.5  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.83 
 
 		 829 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.76 
 
 		 794 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 822 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 838 aa  89  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  27.79 
 
 		 841 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  26.21 
 
 		 855 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 413 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  33.56 
 
 		 431 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.87 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  20.65 
 
 		 868 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 874 aa  84.7  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  35.69 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.41 
 
 		 839 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  25.67 
 
 		 838 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  23.78 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.12 
 
 		 452 aa  80.9  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  38.97 
 
 		 453 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 		 443 aa  80.5  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  24.57 
 
 		 410 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  19.44 
 
 		 367 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.03 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.88 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  22.22 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>