More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3007 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 801 aa  1516    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 848 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.23 
 
 		 843 aa  310  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.11 
 
 		 845 aa  303  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 		 834 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.43 
 
 		 842 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.81 
 
 		 847 aa  271  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 		 873 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  32.45 
 
 		 861 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 853 aa  251  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  32.95 
 
 		 849 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  33.26 
 
 		 849 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 		 852 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 856 aa  236  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.44 
 
 		 854 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 853 aa  226  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 855 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30.6 
 
 		 836 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 		 838 aa  217  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 859 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.44 
 
 		 821 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 873 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 		 857 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  29.42 
 
 		 825 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 		 866 aa  174  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 		 839 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 861 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.8 
 
 		 841 aa  160  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  30.21 
 
 		 855 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  31.49 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 878 aa  142  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.95 
 
 		 835 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 930 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.89 
 
 		 854 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.64 
 
 		 863 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.01 
 
 		 846 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 871 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.75 
 
 		 841 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 		 822 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 857 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 855 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.53 
 
 		 859 aa  114  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.92 
 
 		 850 aa  110  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.03 
 
 		 874 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.04 
 
 		 857 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.95 
 
 		 858 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 855 aa  108  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  33.21 
 
 		 846 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.49 
 
 		 852 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.77 
 
 		 850 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.98 
 
 		 794 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.2 
 
 		 850 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 847 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.59 
 
 		 858 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.98 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.76 
 
 		 851 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  18.96 
 
 		 856 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.36 
 
 		 870 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.45 
 
 		 849 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.09 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 897 aa  77.4  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.55 
 
 		 855 aa  74.3  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  25.84 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.4 
 
 		 408 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.09 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.51 
 
 		 866 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.69 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.46 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  31.37 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.11 
 
 		 415 aa  72  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 419 aa  72  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  36 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 826 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  24.92 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  24.92 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  24.92 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.93 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30.37 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  27.68 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  24 
 
 		 383 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  24.86 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.92 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  36.05 
 
 		 465 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.18 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  24.54 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30.89 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  29.05 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.67 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>