More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4048 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 826 aa  1483    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 855 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.76 
 
 		 841 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 		 838 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.23 
 
 		 825 aa  164  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.72 
 
 		 836 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.99 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.98 
 
 		 821 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 897 aa  144  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 839 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.18 
 
 		 843 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 		 848 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 861 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 930 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.18 
 
 		 854 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 		 855 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.69 
 
 		 847 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.98 
 
 		 842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 846 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 834 aa  125  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.31 
 
 		 849 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  30.8 
 
 		 846 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.77 
 
 		 845 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.15 
 
 		 849 aa  119  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 859 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 		 873 aa  115  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  32.13 
 
 		 828 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 822 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.04 
 
 		 861 aa  104  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 		 857 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.27 
 
 		 855 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 		 852 aa  97.8  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 878 aa  97.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 		 857 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.25 
 
 		 856 aa  94  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.29 
 
 		 866 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 873 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.65 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.15 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.18 
 
 		 851 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.25 
 
 		 858 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.11 
 
 		 850 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.03 
 
 		 452 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 		 806 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.97 
 
 		 427 aa  70.1  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.29 
 
 		 885 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.4 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.45 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  26.28 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  30.28 
 
 		 1130 aa  65.1  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  21.75 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  31.69 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 		 379 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 853 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 833 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  29.71 
 
 		 1090 aa  61.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 853 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  33.93 
 
 		 409 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  21.32 
 
 		 401 aa  60.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  38.57 
 
 		 871 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  28.87 
 
 		 414 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  43.33 
 
 		 853 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.08 
 
 		 410 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.34 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  30.25 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  35.71 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.99 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.27 
 
 		 858 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.92 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  36.36 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.37 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  20.33 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  32.99 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2203  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  21.65 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 1143 aa  58.2  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.34 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  28.57 
 
 		 1207 aa  57.8  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  34.17 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.44 
 
 		 391 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.34 
 
 		 410 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  31.01 
 
 		 419 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  31.13 
 
 		 383 aa  57.4  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 383 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 822 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  26.76 
 
 		 367 aa  57.4  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  28.44 
 
 		 391 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.99 
 
 		 427 aa  57  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  31.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 383 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.48 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>