More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1829 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1877  permease  47.84 
 
 		 808 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  100 
 
 		 797 aa  1590    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  37.58 
 
 		 803 aa  517  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  33.9 
 
 		 814 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.47 
 
 		 869 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  34.8 
 
 		 809 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33.79 
 
 		 802 aa  405  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.95 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.54 
 
 		 821 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.8 
 
 		 805 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  33.87 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.39 
 
 		 813 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33 
 
 		 871 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.43 
 
 		 816 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.9 
 
 		 822 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.49 
 
 		 817 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.5 
 
 		 805 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.37 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.51 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 		 807 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  33.5 
 
 		 808 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.06 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.76 
 
 		 804 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.89 
 
 		 831 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.87 
 
 		 803 aa  366  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 		 807 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 882 aa  363  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 809 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.67 
 
 		 811 aa  360  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.02 
 
 		 808 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.27 
 
 		 805 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.33 
 
 		 804 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.28 
 
 		 809 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  33.49 
 
 		 817 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.77 
 
 		 883 aa  347  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.68 
 
 		 798 aa  346  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.1 
 
 		 806 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.55 
 
 		 808 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.13 
 
 		 893 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.72 
 
 		 862 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.8 
 
 		 810 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.89 
 
 		 844 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32.07 
 
 		 816 aa  331  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.44 
 
 		 915 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.64 
 
 		 845 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 878 aa  327  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.37 
 
 		 874 aa  326  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.58 
 
 		 808 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.14 
 
 		 810 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.98 
 
 		 812 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  32.24 
 
 		 800 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.98 
 
 		 913 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.09 
 
 		 865 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.01 
 
 		 819 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.44 
 
 		 849 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 821 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.15 
 
 		 803 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.57 
 
 		 919 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.11 
 
 		 817 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  33.46 
 
 		 835 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.96 
 
 		 879 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.68 
 
 		 887 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.68 
 
 		 855 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.87 
 
 		 843 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.16 
 
 		 880 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.17 
 
 		 887 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 810 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.33 
 
 		 810 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 813 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.76 
 
 		 888 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.37 
 
 		 861 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.79 
 
 		 848 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.48 
 
 		 846 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.47 
 
 		 884 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.91 
 
 		 819 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.52 
 
 		 820 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  28.42 
 
 		 844 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.09 
 
 		 807 aa  223  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.55 
 
 		 931 aa  214  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  24.64 
 
 		 810 aa  210  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.37 
 
 		 828 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 770 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 805 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 		 784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 817 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 811 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 816 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 797 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 789 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 805 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 805 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 813 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 807 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 801 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 793 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 811 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>