More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0418 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 		 807 aa  1612    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  35.2 
 
 		 821 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.82 
 
 		 813 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.48 
 
 		 817 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.46 
 
 		 805 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.26 
 
 		 823 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.47 
 
 		 814 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.24 
 
 		 805 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.32 
 
 		 822 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.81 
 
 		 871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.42 
 
 		 869 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  35.59 
 
 		 809 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.25 
 
 		 816 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.31 
 
 		 803 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.82 
 
 		 809 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  35.01 
 
 		 796 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.02 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.93 
 
 		 882 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.47 
 
 		 807 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.51 
 
 		 802 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.57 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  34.56 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  35.26 
 
 		 808 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.76 
 
 		 805 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 		 862 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.54 
 
 		 798 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.13 
 
 		 819 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.01 
 
 		 797 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.88 
 
 		 865 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 879 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.37 
 
 		 816 aa  360  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.61 
 
 		 821 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.8 
 
 		 883 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.94 
 
 		 831 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.72 
 
 		 804 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  32.84 
 
 		 800 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.11 
 
 		 810 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 878 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.47 
 
 		 808 aa  349  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 893 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.47 
 
 		 817 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.69 
 
 		 812 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.9 
 
 		 808 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  30.24 
 
 		 804 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.54 
 
 		 887 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.12 
 
 		 810 aa  337  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.3 
 
 		 810 aa  334  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  30.12 
 
 		 809 aa  333  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.7 
 
 		 808 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  31.2 
 
 		 803 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.38 
 
 		 849 aa  328  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 		 915 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 		 844 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  30.96 
 
 		 811 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.53 
 
 		 843 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  28.99 
 
 		 845 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.31 
 
 		 913 aa  310  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.69 
 
 		 855 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.02 
 
 		 808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.77 
 
 		 820 aa  303  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  29.2 
 
 		 803 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  31.23 
 
 		 887 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 817 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  31.83 
 
 		 806 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.31 
 
 		 874 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.08 
 
 		 884 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  30.29 
 
 		 835 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  30.75 
 
 		 819 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 813 aa  277  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.03 
 
 		 880 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.4 
 
 		 919 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.4 
 
 		 844 aa  270  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.73 
 
 		 846 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.25 
 
 		 888 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.94 
 
 		 828 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  28.96 
 
 		 848 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.3 
 
 		 807 aa  240  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 		 809 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.32 
 
 		 810 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 810 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  28.17 
 
 		 861 aa  218  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.31 
 
 		 931 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 788 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 797 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 809 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 784 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 784 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 805 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 792 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 792 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 805 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 794 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 		 798 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 		 770 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 789 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 795 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 805 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 790 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>