More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1896 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1893  permease  53.62 
 
 		 805 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  47.48 
 
 		 808 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  47.17 
 
 		 810 aa  643    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  52.1 
 
 		 802 aa  823    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  100 
 
 		 810 aa  1585    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  42.8 
 
 		 803 aa  570  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  42.19 
 
 		 804 aa  552  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  37.5 
 
 		 798 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  40.54 
 
 		 806 aa  472  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.13 
 
 		 814 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  38.34 
 
 		 835 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  37.82 
 
 		 809 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.86 
 
 		 823 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.7 
 
 		 817 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.24 
 
 		 807 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  36.02 
 
 		 869 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.8 
 
 		 797 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.59 
 
 		 813 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  36.64 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  35.44 
 
 		 796 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  34.31 
 
 		 821 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.8 
 
 		 804 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.8 
 
 		 809 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  36.28 
 
 		 808 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  32.93 
 
 		 803 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 		 816 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.6 
 
 		 809 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.96 
 
 		 807 aa  340  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.1 
 
 		 882 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 805 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.5 
 
 		 817 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.82 
 
 		 816 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.38 
 
 		 808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.17 
 
 		 805 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.17 
 
 		 805 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 871 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.01 
 
 		 845 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.81 
 
 		 811 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.07 
 
 		 800 aa  314  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 822 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  36.59 
 
 		 808 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  34.1 
 
 		 808 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 		 913 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  33.69 
 
 		 887 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 812 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.25 
 
 		 865 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  33.33 
 
 		 887 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 878 aa  301  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.13 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.06 
 
 		 831 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.82 
 
 		 805 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.51 
 
 		 819 aa  297  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  32.63 
 
 		 843 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.97 
 
 		 862 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.22 
 
 		 915 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.64 
 
 		 810 aa  281  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.32 
 
 		 810 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  34.23 
 
 		 819 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.06 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 		 883 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 893 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 809 aa  272  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.72 
 
 		 861 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.59 
 
 		 855 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.04 
 
 		 849 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 879 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.02 
 
 		 880 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.42 
 
 		 844 aa  251  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  30.74 
 
 		 848 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.21 
 
 		 919 aa  248  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.47 
 
 		 874 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.89 
 
 		 884 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 813 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.13 
 
 		 888 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.24 
 
 		 807 aa  230  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.67 
 
 		 817 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.01 
 
 		 820 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.26 
 
 		 846 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  27.64 
 
 		 931 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.12 
 
 		 828 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 770 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 795 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 798 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 807 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 795 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 805 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 795 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 797 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 		 802 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 792 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 816 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 808 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 789 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 804 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 818 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 		 777 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 802 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>