More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0616 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
862 aa  1750    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.84 
 
 
869 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.69 
 
 
871 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.58 
 
 
813 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 
807 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 
805 aa  396  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.55 
 
 
882 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 
823 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.72 
 
 
817 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.6 
 
 
805 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 
807 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.86 
 
 
822 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
809 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.25 
 
 
893 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.38 
 
 
804 aa  355  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  31.52 
 
 
814 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  31.54 
 
 
831 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  31.78 
 
 
805 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.96 
 
 
883 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.44 
 
 
805 aa  340  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  30.72 
 
 
797 aa  338  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.51 
 
 
879 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.55 
 
 
887 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.6 
 
 
878 aa  334  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  32.16 
 
 
803 aa  334  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.69 
 
 
816 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.97 
 
 
809 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  31.74 
 
 
821 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  30.19 
 
 
796 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.21 
 
 
865 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.86 
 
 
805 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.36 
 
 
810 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.24 
 
 
915 aa  318  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.9 
 
 
819 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  30.78 
 
 
800 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.19 
 
 
913 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 
821 aa  310  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.57 
 
 
887 aa  306  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  31.87 
 
 
805 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.97 
 
 
919 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  32.65 
 
 
808 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32 
 
 
816 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.19 
 
 
845 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  28.96 
 
 
802 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.44 
 
 
808 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.31 
 
 
874 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  28.67 
 
 
809 aa  288  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.61 
 
 
843 aa  287  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  29.87 
 
 
803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.03 
 
 
808 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.47 
 
 
849 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.04 
 
 
808 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.41 
 
 
846 aa  277  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.46 
 
 
855 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  30.8 
 
 
810 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.95 
 
 
817 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  29.31 
 
 
811 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.12 
 
 
844 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.56 
 
 
884 aa  270  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.05 
 
 
812 aa  268  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.14 
 
 
880 aa  265  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.59 
 
 
888 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  28.62 
 
 
817 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  30 
 
 
808 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 
820 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  27.8 
 
 
798 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  30.48 
 
 
810 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  30.23 
 
 
806 aa  243  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  28.12 
 
 
803 aa  240  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29.68 
 
 
931 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 
813 aa  224  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 
828 aa  221  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  27.37 
 
 
819 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  28.52 
 
 
861 aa  207  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  27.74 
 
 
804 aa  207  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  27.87 
 
 
835 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  22.97 
 
 
810 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 
809 aa  195  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  26.64 
 
 
844 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  28.51 
 
 
848 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.41 
 
 
807 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 
810 aa  160  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
798 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
811 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
813 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 
817 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 
795 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
805 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 
793 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 
800 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
809 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
799 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 
804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
801 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
816 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 
790 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  24.3 
 
 
788 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 
784 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 
807 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 
795 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>