More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1681 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1681  permease  100 
 
 		 819 aa  1621    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  36.21 
 
 		 814 aa  436  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.09 
 
 		 813 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.22 
 
 		 823 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 817 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 807 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  34.91 
 
 		 821 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.5 
 
 		 871 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  34.11 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.98 
 
 		 869 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.86 
 
 		 805 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.34 
 
 		 822 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  36.86 
 
 		 805 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.96 
 
 		 802 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.64 
 
 		 805 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.92 
 
 		 821 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.66 
 
 		 805 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.76 
 
 		 796 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.55 
 
 		 805 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 807 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.76 
 
 		 809 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.54 
 
 		 798 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  35.73 
 
 		 803 aa  353  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 882 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.79 
 
 		 816 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.68 
 
 		 809 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.89 
 
 		 831 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 862 aa  347  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  33.79 
 
 		 808 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 805 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  34.57 
 
 		 804 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.13 
 
 		 797 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.03 
 
 		 808 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 		 913 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.47 
 
 		 800 aa  327  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.65 
 
 		 810 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.82 
 
 		 808 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  33.26 
 
 		 887 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.29 
 
 		 817 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.02 
 
 		 810 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.78 
 
 		 865 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.98 
 
 		 809 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.35 
 
 		 812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.93 
 
 		 915 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.16 
 
 		 845 aa  306  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.48 
 
 		 843 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 816 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.28 
 
 		 855 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.14 
 
 		 849 aa  300  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 893 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.22 
 
 		 808 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.44 
 
 		 810 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.19 
 
 		 874 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.01 
 
 		 811 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.87 
 
 		 883 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.09 
 
 		 878 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.68 
 
 		 803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.56 
 
 		 844 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.68 
 
 		 887 aa  283  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 879 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.66 
 
 		 808 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.81 
 
 		 835 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.84 
 
 		 803 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 888 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  32.64 
 
 		 806 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 919 aa  267  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.19 
 
 		 844 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.18 
 
 		 817 aa  267  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.31 
 
 		 820 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 880 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.33 
 
 		 810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 846 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.11 
 
 		 819 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.87 
 
 		 848 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.34 
 
 		 861 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 810 aa  247  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 813 aa  243  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 809 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.15 
 
 		 884 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  23.99 
 
 		 807 aa  214  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  31.17 
 
 		 931 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.89 
 
 		 828 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 816 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 784 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.46 
 
 		 797 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 791 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 805 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 813 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 800 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  22.89 
 
 		 807 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 795 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 810 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 805 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 		 804 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 789 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 793 aa  124  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>