More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1883 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1993  permease  54.03 
 
 		 808 aa  756    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  100 
 
 		 808 aa  1623    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  42.93 
 
 		 811 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.59 
 
 		 878 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.22 
 
 		 817 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  36.64 
 
 		 817 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.25 
 
 		 817 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  36.27 
 
 		 887 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  37.18 
 
 		 796 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.59 
 
 		 814 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.65 
 
 		 822 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 813 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  35.64 
 
 		 805 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.57 
 
 		 882 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.76 
 
 		 805 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.15 
 
 		 823 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  33.13 
 
 		 802 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 807 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  37.3 
 
 		 808 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  34.9 
 
 		 804 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.7 
 
 		 807 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  34.23 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 		 880 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 871 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  35.93 
 
 		 804 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.92 
 
 		 855 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  36.85 
 
 		 805 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  35.09 
 
 		 821 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.73 
 
 		 816 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  36.24 
 
 		 810 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 915 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  36.37 
 
 		 806 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.98 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  36.79 
 
 		 809 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  34.92 
 
 		 798 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  34.22 
 
 		 809 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  32.69 
 
 		 803 aa  379  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.59 
 
 		 800 aa  373  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  32.04 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  36.28 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.73 
 
 		 844 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.58 
 
 		 809 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  34.69 
 
 		 844 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 805 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.92 
 
 		 845 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  34.72 
 
 		 848 aa  364  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 913 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.82 
 
 		 812 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 884 aa  353  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.36 
 
 		 805 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.05 
 
 		 874 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.74 
 
 		 831 aa  350  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 888 aa  349  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.69 
 
 		 819 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.15 
 
 		 862 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.34 
 
 		 803 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.73 
 
 		 821 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.65 
 
 		 865 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.22 
 
 		 849 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  34.81 
 
 		 808 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  34.64 
 
 		 843 aa  340  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.03 
 
 		 808 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.62 
 
 		 816 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 883 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 919 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.02 
 
 		 861 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.02 
 
 		 887 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.17 
 
 		 805 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.65 
 
 		 893 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 809 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.55 
 
 		 879 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.52 
 
 		 835 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  29.4 
 
 		 810 aa  290  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.62 
 
 		 846 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 813 aa  287  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.64 
 
 		 810 aa  287  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.69 
 
 		 819 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.19 
 
 		 820 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  32.07 
 
 		 931 aa  260  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  27.72 
 
 		 807 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 810 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.45 
 
 		 828 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 804 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 791 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 		 792 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 		 790 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 788 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 797 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 795 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 816 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 770 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 805 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 		 811 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.29 
 
 		 789 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 798 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 		 793 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 		 811 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  25.4 
 
 		 835 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 791 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 795 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>