More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1828 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1828  permease  100 
 
 		 803 aa  1589    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.47 
 
 		 882 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 823 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.31 
 
 		 807 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.55 
 
 		 814 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  38.16 
 
 		 796 aa  426  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  38.13 
 
 		 869 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.31 
 
 		 805 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  37.41 
 
 		 821 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.76 
 
 		 813 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  37.65 
 
 		 805 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.19 
 
 		 816 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  36.8 
 
 		 809 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  34.44 
 
 		 797 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  35.4 
 
 		 831 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.5 
 
 		 871 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.78 
 
 		 809 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  35.52 
 
 		 802 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.36 
 
 		 807 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.9 
 
 		 822 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  36.5 
 
 		 800 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  36.39 
 
 		 798 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 		 915 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  35.44 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.74 
 
 		 805 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.16 
 
 		 862 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  35.82 
 
 		 805 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.3 
 
 		 855 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  36.67 
 
 		 804 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.68 
 
 		 913 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  33.13 
 
 		 804 aa  353  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.91 
 
 		 883 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  35.73 
 
 		 819 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  34.75 
 
 		 865 aa  347  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  37.26 
 
 		 808 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 874 aa  343  9e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 821 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.44 
 
 		 893 aa  340  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  34.26 
 
 		 808 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.52 
 
 		 878 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  35.79 
 
 		 811 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 		 805 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.24 
 
 		 809 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.89 
 
 		 817 aa  330  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 		 812 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  34.89 
 
 		 887 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.21 
 
 		 879 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.13 
 
 		 888 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.29 
 
 		 817 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.05 
 
 		 816 aa  322  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.69 
 
 		 849 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.16 
 
 		 844 aa  320  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.97 
 
 		 808 aa  316  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 808 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 		 810 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 919 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  33.25 
 
 		 887 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.63 
 
 		 845 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.84 
 
 		 803 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  35.13 
 
 		 810 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  33.22 
 
 		 843 aa  293  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  31.18 
 
 		 803 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  33.72 
 
 		 848 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  35.4 
 
 		 835 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.98 
 
 		 846 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  34.91 
 
 		 806 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.34 
 
 		 808 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.75 
 
 		 861 aa  273  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 820 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  31.4 
 
 		 844 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.93 
 
 		 880 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  33.13 
 
 		 819 aa  253  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.18 
 
 		 828 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.73 
 
 		 884 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.64 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 		 813 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 809 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 810 aa  195  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.41 
 
 		 807 aa  187  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.01 
 
 		 931 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 816 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 811 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 798 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 804 aa  168  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 794 aa  167  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 790 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 795 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 810 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 802 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.45 
 
 		 790 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 784 aa  158  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 		 808 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 792 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 804 aa  157  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 788 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 795 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 804 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  23.03 
 
 		 809 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>