More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3350 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
828 aa  1671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 
913 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.94 
 
 
915 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.59 
 
 
811 aa  267  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  27.9 
 
 
814 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.24 
 
 
855 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.36 
 
 
849 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.94 
 
 
807 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 
844 aa  244  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  27.22 
 
 
821 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.7 
 
 
874 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.24 
 
 
823 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.55 
 
 
817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.95 
 
 
805 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  29.13 
 
 
808 aa  231  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.23 
 
 
810 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 
878 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  27.02 
 
 
831 aa  225  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 
862 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.18 
 
 
919 aa  221  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.11 
 
 
807 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  27.29 
 
 
798 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 
888 aa  218  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  28.25 
 
 
796 aa  218  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  26.18 
 
 
845 aa  217  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.86 
 
 
893 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.15 
 
 
813 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.21 
 
 
809 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  28.18 
 
 
803 aa  212  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  27.53 
 
 
887 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  26.8 
 
 
809 aa  210  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.49 
 
 
846 aa  210  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  26.34 
 
 
802 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.52 
 
 
812 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.8 
 
 
882 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.65 
 
 
805 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  29.32 
 
 
804 aa  207  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.58 
 
 
869 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.33 
 
 
884 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  25.73 
 
 
810 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.29 
 
 
808 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.17 
 
 
880 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  27.09 
 
 
805 aa  197  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.76 
 
 
871 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.79 
 
 
817 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  27.57 
 
 
808 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  26.63 
 
 
843 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.87 
 
 
805 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.11 
 
 
883 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  28.49 
 
 
800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  24.37 
 
 
797 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.97 
 
 
816 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  27.99 
 
 
861 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  27.36 
 
 
809 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  25.03 
 
 
804 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.61 
 
 
822 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 
820 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  26.45 
 
 
803 aa  174  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  24.77 
 
 
817 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 
821 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  25.73 
 
 
805 aa  171  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.09 
 
 
805 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  27.21 
 
 
835 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  26.23 
 
 
819 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  25.96 
 
 
808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  23.38 
 
 
813 aa  163  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  24.76 
 
 
803 aa  163  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  26.24 
 
 
848 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  23 
 
 
810 aa  157  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  25.59 
 
 
810 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.65 
 
 
879 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  25.09 
 
 
816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  25.34 
 
 
887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 
809 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  26.09 
 
 
806 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  23.29 
 
 
807 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  23.07 
 
 
810 aa  144  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  25.19 
 
 
819 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.03 
 
 
844 aa  140  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  25.03 
 
 
865 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  25.5 
 
 
931 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
808 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
804 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 
788 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
806 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 
801 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 
801 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 
805 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 
798 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 
800 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 
797 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  22.66 
 
 
793 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 
807 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 
811 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 
790 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  19.86 
 
 
800 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 
795 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 
785 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 
805 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
799 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>