More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0776 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0776  putative permease  100 
 
 
807 aa  1652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
809 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  30.62 
 
 
810 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
813 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
810 aa  330  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  25.86 
 
 
809 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  27.48 
 
 
804 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  25.73 
 
 
845 aa  270  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  27.5 
 
 
843 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  27.54 
 
 
821 aa  264  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  26.42 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  28.66 
 
 
805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  27.19 
 
 
805 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.3 
 
 
807 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.52 
 
 
817 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.74 
 
 
813 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.06 
 
 
871 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.3 
 
 
807 aa  240  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.73 
 
 
849 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.77 
 
 
809 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25.45 
 
 
798 aa  233  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 
822 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.03 
 
 
823 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.26 
 
 
915 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  26.14 
 
 
808 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  25.99 
 
 
810 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  25.09 
 
 
797 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.34 
 
 
844 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  27.14 
 
 
796 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  25.35 
 
 
814 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.98 
 
 
809 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.2 
 
 
805 aa  211  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  25.8 
 
 
804 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.39 
 
 
816 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.48 
 
 
805 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.21 
 
 
882 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 
805 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  27.68 
 
 
808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.33 
 
 
808 aa  201  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  24.94 
 
 
803 aa  201  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  24.29 
 
 
803 aa  200  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.64 
 
 
869 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  25 
 
 
865 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.53 
 
 
878 aa  193  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  24.2 
 
 
810 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  25.54 
 
 
816 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  26.65 
 
 
808 aa  187  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.94 
 
 
805 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  24.08 
 
 
887 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  26.09 
 
 
831 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  24.79 
 
 
887 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  25.45 
 
 
811 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  23.53 
 
 
819 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  25.15 
 
 
808 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24 
 
 
913 aa  177  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  24.67 
 
 
806 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.75 
 
 
874 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.41 
 
 
862 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.05 
 
 
893 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.66 
 
 
821 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.81 
 
 
883 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  24.28 
 
 
800 aa  170  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.67 
 
 
844 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.4 
 
 
919 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  22.83 
 
 
817 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  24.09 
 
 
848 aa  164  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.34 
 
 
820 aa  164  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.67 
 
 
879 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  25.92 
 
 
835 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  24.21 
 
 
803 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24 
 
 
810 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.29 
 
 
828 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.24 
 
 
855 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.42 
 
 
812 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.63 
 
 
888 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.45 
 
 
817 aa  137  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.86 
 
 
846 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  22.34 
 
 
819 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  24.27 
 
 
931 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  23.83 
 
 
861 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.74 
 
 
884 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 
792 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
794 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
808 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
795 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
791 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
805 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 
808 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 
798 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
804 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.85 
 
 
880 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  23.52 
 
 
789 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
811 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 
806 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 
805 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 
791 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  22.51 
 
 
830 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 
797 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
795 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 
795 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>