More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3155 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1821    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  37.29 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  38.21 
 
 		 848 aa  396  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  35.57 
 
 		 887 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.1 
 
 		 887 aa  334  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.87 
 
 		 878 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  34.21 
 
 		 861 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  31.13 
 
 		 869 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.3 
 
 		 871 aa  274  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.68 
 
 		 862 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  31.65 
 
 		 865 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.54 
 
 		 915 aa  273  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.22 
 
 		 817 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  30.8 
 
 		 814 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.51 
 
 		 798 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  32.38 
 
 		 809 aa  258  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  29.18 
 
 		 804 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  29.3 
 
 		 802 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  30.9 
 
 		 817 aa  254  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  31.58 
 
 		 805 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  29.55 
 
 		 797 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.08 
 
 		 880 aa  250  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.05 
 
 		 809 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  30.36 
 
 		 821 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.27 
 
 		 913 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.83 
 
 		 823 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  31.79 
 
 		 804 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.3 
 
 		 883 aa  244  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 807 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.9 
 
 		 807 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  31.28 
 
 		 808 aa  242  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 893 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.01 
 
 		 810 aa  240  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.19 
 
 		 808 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 		 817 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.81 
 
 		 855 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.08 
 
 		 805 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.05 
 
 		 849 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  30.67 
 
 		 811 aa  237  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.64 
 
 		 805 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.76 
 
 		 846 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.35 
 
 		 919 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.22 
 
 		 882 aa  224  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  28.78 
 
 		 796 aa  224  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.3 
 
 		 844 aa  224  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  28.65 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.19 
 
 		 805 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.61 
 
 		 845 aa  221  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.26 
 
 		 813 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.07 
 
 		 884 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.53 
 
 		 843 aa  219  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.67 
 
 		 816 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  28.96 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.33 
 
 		 874 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  30.86 
 
 		 819 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29 
 
 		 822 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.21 
 
 		 805 aa  210  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  29.38 
 
 		 808 aa  207  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  29.99 
 
 		 805 aa  205  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  29.15 
 
 		 831 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  26.15 
 
 		 803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  30.01 
 
 		 803 aa  197  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.42 
 
 		 809 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  28.24 
 
 		 808 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  27.73 
 
 		 810 aa  194  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  28.25 
 
 		 835 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.86 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.74 
 
 		 821 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  30.67 
 
 		 806 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.01 
 
 		 879 aa  182  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.1 
 
 		 808 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  27.83 
 
 		 816 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.06 
 
 		 820 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.26 
 
 		 828 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 809 aa  167  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.52 
 
 		 807 aa  165  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 813 aa  163  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.45 
 
 		 810 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.71 
 
 		 888 aa  154  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  28.06 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.16 
 
 		 403 aa  109  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 816 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 		 790 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.37 
 
 		 400 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  23.53 
 
 		 835 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.29 
 
 		 402 aa  105  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  28.52 
 
 		 402 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  27.65 
 
 		 401 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 805 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.67 
 
 		 400 aa  99  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 785 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  28.12 
 
 		 400 aa  99  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 798 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 402 aa  97.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.7 
 
 		 402 aa  97.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 794 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 		 804 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 		 398 aa  95.1  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>