More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0307 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 809 aa  767    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 810 aa  1654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 		 810 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  33.05 
 
 		 813 aa  465  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  30.98 
 
 		 807 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  28.73 
 
 		 804 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.19 
 
 		 845 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  30.71 
 
 		 802 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  29.98 
 
 		 843 aa  317  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.79 
 
 		 805 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  28.57 
 
 		 796 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 822 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  28.62 
 
 		 798 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.13 
 
 		 809 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.12 
 
 		 813 aa  301  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.01 
 
 		 817 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  29.46 
 
 		 808 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  28.61 
 
 		 805 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  29.02 
 
 		 809 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  27.38 
 
 		 814 aa  283  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.17 
 
 		 808 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.78 
 
 		 823 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 882 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  29.5 
 
 		 804 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.53 
 
 		 803 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 		 805 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.96 
 
 		 809 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.55 
 
 		 807 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  26.89 
 
 		 816 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.34 
 
 		 869 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  26.36 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.36 
 
 		 805 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.26 
 
 		 871 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.75 
 
 		 816 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.61 
 
 		 807 aa  257  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  27.85 
 
 		 810 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  27.13 
 
 		 810 aa  257  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  27.28 
 
 		 865 aa  253  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  29.26 
 
 		 808 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  27.69 
 
 		 831 aa  250  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  25.68 
 
 		 821 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  26.96 
 
 		 819 aa  247  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.08 
 
 		 805 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 		 805 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.15 
 
 		 849 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 883 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  26.49 
 
 		 800 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  24.7 
 
 		 797 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  25.32 
 
 		 817 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  27.27 
 
 		 808 aa  228  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  25.89 
 
 		 808 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  27.88 
 
 		 803 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.11 
 
 		 862 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.03 
 
 		 915 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.04 
 
 		 821 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  27.57 
 
 		 811 aa  218  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 844 aa  218  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  26.28 
 
 		 819 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  27.02 
 
 		 848 aa  215  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.09 
 
 		 812 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.13 
 
 		 878 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 884 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.57 
 
 		 817 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  26.1 
 
 		 887 aa  208  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.89 
 
 		 879 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  26.51 
 
 		 806 aa  203  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  26.5 
 
 		 835 aa  203  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  25.32 
 
 		 887 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.09 
 
 		 893 aa  197  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.06 
 
 		 810 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.56 
 
 		 913 aa  193  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26 
 
 		 874 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.52 
 
 		 844 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.32 
 
 		 919 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.79 
 
 		 880 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  26.39 
 
 		 861 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.58 
 
 		 888 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.03 
 
 		 855 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.98 
 
 		 828 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.81 
 
 		 820 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.87 
 
 		 846 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  25.23 
 
 		 931 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 793 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 793 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 		 791 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 790 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 790 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 801 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 800 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  21.86 
 
 		 808 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 804 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 806 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 805 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 402 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  22.02 
 
 		 807 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.09 
 
 		 402 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 770 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  28.05 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>