More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4528 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
809 aa  1623    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.28 
 
 
823 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.41 
 
 
817 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.82 
 
 
871 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.35 
 
 
814 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.53 
 
 
813 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.91 
 
 
882 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.64 
 
 
796 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.26 
 
 
805 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.82 
 
 
807 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.59 
 
 
805 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.96 
 
 
822 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.2 
 
 
869 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.36 
 
 
807 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.7 
 
 
821 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.39 
 
 
805 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
862 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.89 
 
 
802 aa  399  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.21 
 
 
797 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.78 
 
 
803 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 
816 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  34.63 
 
 
805 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  33.94 
 
 
800 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.18 
 
 
831 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.58 
 
 
865 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  34.38 
 
 
887 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.48 
 
 
805 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.81 
 
 
878 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.78 
 
 
809 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.66 
 
 
805 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.77 
 
 
893 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.68 
 
 
879 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  33.85 
 
 
803 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  33.74 
 
 
810 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 
821 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.05 
 
 
798 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.33 
 
 
804 aa  354  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  34.76 
 
 
819 aa  349  9e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 
808 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.39 
 
 
809 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.65 
 
 
913 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.66 
 
 
804 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.67 
 
 
874 aa  343  8e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.13 
 
 
915 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  31.45 
 
 
816 aa  340  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  32.73 
 
 
808 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.09 
 
 
811 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.85 
 
 
844 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  32.7 
 
 
808 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.36 
 
 
883 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.87 
 
 
919 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.6 
 
 
810 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.75 
 
 
849 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.37 
 
 
808 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.16 
 
 
845 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.62 
 
 
808 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.18 
 
 
887 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  31.87 
 
 
803 aa  317  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 
817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.12 
 
 
812 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 
888 aa  301  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  31.11 
 
 
817 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  32.73 
 
 
806 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 
855 aa  298  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.12 
 
 
843 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.61 
 
 
835 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.39 
 
 
880 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.27 
 
 
810 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
813 aa  283  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.29 
 
 
884 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  27.51 
 
 
810 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.28 
 
 
820 aa  257  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.62 
 
 
846 aa  257  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 
809 aa  257  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  27.77 
 
 
807 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.78 
 
 
861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  30.21 
 
 
819 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  31.42 
 
 
848 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.63 
 
 
844 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  31.05 
 
 
931 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 
810 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.58 
 
 
828 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
795 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
795 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
813 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
792 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
811 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 
805 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 
798 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
811 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
788 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
805 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
809 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 
777 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
809 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 
800 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 
805 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 
790 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
791 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>