More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1814 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1814  permease  100 
 
 		 809 aa  1600    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  38.47 
 
 		 816 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  39.01 
 
 		 814 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.44 
 
 		 823 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.85 
 
 		 816 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.59 
 
 		 807 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.62 
 
 		 805 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  39.42 
 
 		 808 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  36.45 
 
 		 821 aa  448  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  37.7 
 
 		 869 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  34.8 
 
 		 797 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.79 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.39 
 
 		 813 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.96 
 
 		 882 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  34.56 
 
 		 802 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  37.64 
 
 		 805 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  37.73 
 
 		 796 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  36.23 
 
 		 887 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.14 
 
 		 805 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.33 
 
 		 871 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  36.11 
 
 		 804 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  36.94 
 
 		 804 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  35.98 
 
 		 798 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  37.43 
 
 		 831 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.44 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  35.38 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.82 
 
 		 822 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  33.82 
 
 		 803 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  36.23 
 
 		 805 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.77 
 
 		 878 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.78 
 
 		 809 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  37.7 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  34.89 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  36.28 
 
 		 808 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  36.8 
 
 		 803 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.46 
 
 		 800 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  37.44 
 
 		 806 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  32.31 
 
 		 845 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 805 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.48 
 
 		 805 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  33.66 
 
 		 809 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  37.06 
 
 		 811 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  34.68 
 
 		 865 aa  357  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.52 
 
 		 808 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.97 
 
 		 862 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  36.79 
 
 		 808 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.39 
 
 		 808 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.49 
 
 		 913 aa  344  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.14 
 
 		 817 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.03 
 
 		 893 aa  337  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.68 
 
 		 819 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.5 
 
 		 883 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  33.02 
 
 		 887 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 915 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  32.73 
 
 		 803 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 		 855 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  34.32 
 
 		 835 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.42 
 
 		 874 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  35.2 
 
 		 844 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  35.83 
 
 		 848 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 821 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 810 aa  320  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 844 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 813 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.81 
 
 		 849 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  34.92 
 
 		 843 aa  304  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 		 809 aa  300  8e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.45 
 
 		 820 aa  297  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  28.9 
 
 		 810 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 		 879 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.02 
 
 		 812 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.06 
 
 		 880 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.2 
 
 		 884 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  34.33 
 
 		 861 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 919 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 810 aa  274  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  33.37 
 
 		 819 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  32.38 
 
 		 931 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.85 
 
 		 888 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.99 
 
 		 807 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.25 
 
 		 846 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.36 
 
 		 828 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 804 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 801 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 811 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 795 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 816 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 		 800 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 790 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.05 
 
 		 813 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 816 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 		 792 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 798 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 798 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  23.44 
 
 		 830 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 810 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 808 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 795 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 789 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>