More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1898 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1898  permease  100 
 
 		 808 aa  1599    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  46.86 
 
 		 805 aa  692    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  44.06 
 
 		 798 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  47.6 
 
 		 810 aa  648    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  46.93 
 
 		 810 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  46.41 
 
 		 804 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  49.07 
 
 		 802 aa  754    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  44.69 
 
 		 806 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  40.05 
 
 		 803 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  38.22 
 
 		 814 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  41.01 
 
 		 835 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  39.42 
 
 		 809 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  35.83 
 
 		 804 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.84 
 
 		 796 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.26 
 
 		 807 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.53 
 
 		 823 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  35.49 
 
 		 821 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.25 
 
 		 871 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  34.07 
 
 		 809 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.94 
 
 		 882 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  38.16 
 
 		 869 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.79 
 
 		 797 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.6 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.39 
 
 		 805 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.8 
 
 		 822 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.06 
 
 		 807 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.21 
 
 		 817 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  37.15 
 
 		 811 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.77 
 
 		 816 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.97 
 
 		 878 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.1 
 
 		 805 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  37.18 
 
 		 808 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  34.56 
 
 		 887 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.39 
 
 		 845 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 915 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.53 
 
 		 831 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.84 
 
 		 800 aa  363  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  35.8 
 
 		 808 aa  360  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.18 
 
 		 816 aa  360  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.73 
 
 		 809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.3 
 
 		 805 aa  356  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  32.76 
 
 		 803 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 808 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  34.08 
 
 		 819 aa  355  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  33.02 
 
 		 817 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.03 
 
 		 805 aa  350  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.66 
 
 		 803 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.16 
 
 		 805 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.48 
 
 		 808 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.41 
 
 		 893 aa  337  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 883 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 844 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  34.51 
 
 		 865 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 809 aa  330  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.49 
 
 		 817 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  33.49 
 
 		 843 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  33.76 
 
 		 844 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.05 
 
 		 913 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.82 
 
 		 879 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  34.31 
 
 		 848 aa  312  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 813 aa  310  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  32.16 
 
 		 887 aa  310  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.18 
 
 		 862 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  29.58 
 
 		 810 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.81 
 
 		 849 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.48 
 
 		 874 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 821 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.69 
 
 		 855 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.26 
 
 		 810 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 810 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.78 
 
 		 812 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 		 919 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.33 
 
 		 888 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  33.49 
 
 		 861 aa  278  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 880 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 820 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  32.68 
 
 		 819 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  26.47 
 
 		 807 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 884 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.03 
 
 		 931 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.21 
 
 		 846 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.25 
 
 		 828 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 770 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 795 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 810 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 789 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 797 aa  134  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 786 aa  130  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 		 788 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 809 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 777 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 793 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 807 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 		 798 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 792 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 801 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 789 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 811 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>