More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1886 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1574    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 		 848 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  32.84 
 
 		 834 aa  269  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  32.37 
 
 		 842 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.46 
 
 		 845 aa  248  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.57 
 
 		 843 aa  247  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.59 
 
 		 847 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 		 855 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 		 859 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 852 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  29.38 
 
 		 836 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 873 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 856 aa  214  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 838 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30.14 
 
 		 861 aa  207  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 857 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.64 
 
 		 849 aa  204  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.99 
 
 		 854 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.2 
 
 		 849 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  30.72 
 
 		 841 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.2 
 
 		 825 aa  191  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 839 aa  184  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 		 861 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 		 806 aa  177  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 		 855 aa  173  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.65 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.81 
 
 		 846 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 866 aa  161  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 897 aa  157  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.98 
 
 		 930 aa  155  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 878 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.27 
 
 		 859 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.47 
 
 		 880 aa  150  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 855 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.17 
 
 		 835 aa  130  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.31 
 
 		 851 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.19 
 
 		 854 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.05 
 
 		 863 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.16 
 
 		 873 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  40.99 
 
 		 853 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 853 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  30.42 
 
 		 828 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  25.84 
 
 		 858 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 849 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 		 822 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.94 
 
 		 850 aa  101  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 		 849 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.25 
 
 		 850 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 822 aa  97.8  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.56 
 
 		 801 aa  96.3  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.08 
 
 		 849 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.31 
 
 		 841 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.91 
 
 		 858 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  36.05 
 
 		 857 aa  84.3  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 410 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  19.33 
 
 		 858 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.56 
 
 		 387 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.9 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  44 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.63 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.02 
 
 		 850 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  35.16 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.53 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  19.46 
 
 		 857 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.09 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 847 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.28 
 
 		 852 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.13 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  34.85 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  26.83 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.96 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  35.04 
 
 		 453 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  34.39 
 
 		 405 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  36.07 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.07 
 
 		 411 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.95 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30.14 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  30.04 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 386 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  23.56 
 
 		 397 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.37 
 
 		 656 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.09 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 		 658 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.12 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1175  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.63 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  30.26 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.16 
 
 		 807 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.21 
 
 		 829 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.22 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  30.86 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.21 
 
 		 829 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  26.67 
 
 		 657 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.71 
 
 		 855 aa  72  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  72  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>