More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 859 aa  1631    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  48.48 
 
 		 871 aa  602  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  42.7 
 
 		 878 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  44.16 
 
 		 857 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  43.6 
 
 		 855 aa  459  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.51 
 
 		 880 aa  389  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 897 aa  345  2e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  39.07 
 
 		 846 aa  338  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  38.36 
 
 		 846 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 855 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.18 
 
 		 835 aa  271  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  33.3 
 
 		 836 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.52 
 
 		 838 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.51 
 
 		 930 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.95 
 
 		 845 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.14 
 
 		 825 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.45 
 
 		 841 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30 
 
 		 843 aa  227  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.14 
 
 		 847 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 		 848 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  39.07 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  31.49 
 
 		 861 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.81 
 
 		 842 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27 
 
 		 854 aa  201  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 839 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 873 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 852 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 		 859 aa  190  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 		 834 aa  189  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 853 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  32.86 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  29.57 
 
 		 849 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  29.8 
 
 		 849 aa  181  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.47 
 
 		 861 aa  177  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  31.67 
 
 		 853 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  31.43 
 
 		 821 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 806 aa  165  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 826 aa  157  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 866 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 		 853 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.27 
 
 		 858 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.69 
 
 		 857 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 855 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  21.25 
 
 		 896 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.02 
 
 		 858 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.76 
 
 		 851 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.92 
 
 		 855 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 822 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  34.1 
 
 		 488 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.39 
 
 		 855 aa  87.8  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.81 
 
 		 850 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.71 
 
 		 849 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 847 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  29.1 
 
 		 854 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.04 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 857 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  42.03 
 
 		 873 aa  79.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 856 aa  78.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.41 
 
 		 390 aa  77.4  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  22.37 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.5 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  20.68 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.26 
 
 		 829 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  22.68 
 
 		 868 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.48 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.05 
 
 		 829 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 		 409 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 		 411 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.25 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.74 
 
 		 794 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.71 
 
 		 870 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  20.71 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.31 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.91 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  32.37 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.06 
 
 		 852 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  22.75 
 
 		 391 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  28.31 
 
 		 397 aa  67.4  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  27.62 
 
 		 829 aa  67  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 775 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.87 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.09 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  31.76 
 
 		 850 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.04 
 
 		 847 aa  66.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  26.49 
 
 		 846 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  36.05 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  27.59 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  22.29 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  25.31 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.08 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  23.03 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.66 
 
 		 642 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>