202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4065 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 488 aa  901    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0645  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176545  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 		 878 aa  91.3  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.2 
 
 		 835 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 		 855 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34 
 
 		 859 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  35.64 
 
 		 857 aa  83.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  33.22 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.76 
 
 		 848 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 846 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.17 
 
 		 845 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 		 871 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 897 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30.29 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.5 
 
 		 843 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  34.46 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.72 
 
 		 846 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.29 
 
 		 854 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 853 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  41.57 
 
 		 834 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  32.89 
 
 		 842 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  42.42 
 
 		 841 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  45.88 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  43.62 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31 
 
 		 930 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.46 
 
 		 825 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 838 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 853 aa  60.1  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  38.95 
 
 		 861 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  36.8 
 
 		 849 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  27.81 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.39 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  35.48 
 
 		 855 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 847 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  37.39 
 
 		 806 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.89 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.72 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  30 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.73 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  33.71 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  43.24 
 
 		 821 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 856 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.33 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  36 
 
 		 849 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 873 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  31.94 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.53 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  31.94 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  42.03 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.39 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 466 aa  50.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.92 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  39.06 
 
 		 873 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.99 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 		 852 aa  50.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  31.58 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  21.52 
 
 		 947 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.25 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.46 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.82 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 		 857 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  34.38 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 		 941 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  35.9 
 
 		 850 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.24 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  25.55 
 
 		 418 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 833 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 		 822 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.53 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.82 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.08 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 		 801 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.24 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  34.44 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  28.47 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.86 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>