More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2393 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
857 aa  1603    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  46.05 
 
 
871 aa  509  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  44.88 
 
 
859 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  38 
 
 
878 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  41.3 
 
 
855 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  32.75 
 
 
880 aa  348  3e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  39.72 
 
 
846 aa  339  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
897 aa  280  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  33.26 
 
 
836 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.66 
 
 
835 aa  247  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 
838 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  35.77 
 
 
855 aa  243  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.55 
 
 
841 aa  238  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  31.96 
 
 
825 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.07 
 
 
848 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  34.69 
 
 
839 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  28.09 
 
 
854 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
856 aa  212  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  39.05 
 
 
738 aa  207  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.78 
 
 
828 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  28.52 
 
 
842 aa  197  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 
853 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.57 
 
 
847 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  30.97 
 
 
845 aa  187  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 
861 aa  184  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.92 
 
 
843 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 
859 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 
852 aa  160  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.32 
 
 
861 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.61 
 
 
930 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.99 
 
 
821 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  32.67 
 
 
849 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  32.12 
 
 
849 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 
834 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.74 
 
 
855 aa  140  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
806 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 
853 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  34.99 
 
 
826 aa  120  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.26 
 
 
858 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.59 
 
 
857 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 
866 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.49 
 
 
857 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  36.5 
 
 
488 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  42.25 
 
 
873 aa  97.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  18.9 
 
 
896 aa  94  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.7 
 
 
856 aa  93.2  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 
443 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 
452 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.7 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  26.46 
 
 
851 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
822 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.44 
 
 
849 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.71 
 
 
397 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.91 
 
 
870 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.93 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.93 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.92 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  40.74 
 
 
873 aa  74.3  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.26 
 
 
397 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.49 
 
 
641 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.37 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
406 aa  72  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  30.09 
 
 
850 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.92 
 
 
397 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.86 
 
 
397 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 
849 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  22.63 
 
 
868 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.35 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 
833 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 
853 aa  68.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  30.22 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  24.63 
 
 
885 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.44 
 
 
397 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
457 aa  65.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
413 aa  66.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
855 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.36 
 
 
419 aa  64.7  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  19.15 
 
 
850 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
404 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.61 
 
 
406 aa  63.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  20.43 
 
 
684 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  35.29 
 
 
855 aa  62.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  28.57 
 
 
653 aa  62.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.75 
 
 
404 aa  62.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.49 
 
 
397 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.28 
 
 
409 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
413 aa  62.4  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.51 
 
 
663 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.64 
 
 
664 aa  62  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
414 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.28 
 
 
409 aa  62  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
397 aa  62.4  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.14 
 
 
437 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
412 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  25.37 
 
 
441 aa  62  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 
792 aa  61.6  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.86 
 
 
398 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  31.25 
 
 
383 aa  61.6  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 
654 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.41 
 
 
385 aa  60.8  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>