More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2542 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  886    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 
436 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  36.96 
 
 
406 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  36.69 
 
 
409 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  33.09 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  32.53 
 
 
406 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  32.09 
 
 
429 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  32.53 
 
 
407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  32.89 
 
 
404 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 
413 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  30.68 
 
 
419 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
475 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  30.39 
 
 
716 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  32.22 
 
 
416 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  29.08 
 
 
422 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.79 
 
 
465 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.55 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  31.3 
 
 
475 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.7 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.01 
 
 
400 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  32.09 
 
 
405 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  32.18 
 
 
387 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6148  hypothetical protein  32.76 
 
 
405 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6495  hypothetical protein  32.8 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.96926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.19 
 
 
419 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 
412 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  24.54 
 
 
425 aa  117  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
411 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.92 
 
 
419 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.15 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  25.51 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.3 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.26 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  25.21 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.11 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.38 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.95 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.17 
 
 
415 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  27.06 
 
 
414 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  25.82 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  25.77 
 
 
428 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.97 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.07 
 
 
423 aa  86.3  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.12 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.61 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.47 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.53 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2433  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.77 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0865492  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.84 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.98 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.3 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.3 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 
830 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.54 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 
535 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.11 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  38.53 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.32 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.47 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  23.11 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  23.59 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.49 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.02 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.97 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.49 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1229  hypothetical protein  26.51 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.965608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0813  hypothetical protein  26.82 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2089  protein of unknown function DUF214  21.93 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00149352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.55 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  23.31 
 
 
427 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1079  hypothetical protein  23.79 
 
 
655 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.12 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.44 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  25.15 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  22.62 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.83 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.91 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.59 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.14 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.77 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.74 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.13 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.97 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.74 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  25.12 
 
 
661 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>