More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2238 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 822 aa  1540    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 855 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  29.96 
 
 		 825 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.62 
 
 		 836 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  31.59 
 
 		 839 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 838 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.21 
 
 		 842 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.86 
 
 		 843 aa  134  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.95 
 
 		 841 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 		 855 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  27.82 
 
 		 821 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 848 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 		 861 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.23 
 
 		 854 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.66 
 
 		 852 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.78 
 
 		 846 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 873 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 856 aa  114  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.21 
 
 		 845 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.35 
 
 		 859 aa  107  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  27.77 
 
 		 806 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.42 
 
 		 880 aa  104  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 		 859 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.3 
 
 		 847 aa  103  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 853 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 871 aa  99  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  29.24 
 
 		 828 aa  98.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 834 aa  97.4  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 930 aa  96.3  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.5 
 
 		 835 aa  96.3  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.75 
 
 		 861 aa  95.5  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  24.45 
 
 		 878 aa  94.4  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.46 
 
 		 855 aa  91.3  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 853 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.68 
 
 		 849 aa  77  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.1 
 
 		 849 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.06 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.47 
 
 		 857 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.18 
 
 		 854 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 		 857 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 866 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.96 
 
 		 858 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  29.61 
 
 		 355 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  33.17 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.14 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  28.49 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  31.16 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.24 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  31.16 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  21.45 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  36.88 
 
 		 738 aa  60.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  27.14 
 
 		 414 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 838 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.01 
 
 		 856 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.31 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.88 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  26.28 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25.1 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.97 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 		 384 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  25.65 
 
 		 418 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 383 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  24.43 
 
 		 416 aa  57  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  25.1 
 
 		 391 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  25.1 
 
 		 391 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.41 
 
 		 851 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  25.1 
 
 		 391 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.21 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.67 
 
 		 418 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 406 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.35 
 
 		 393 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.77 
 
 		 415 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  29.42 
 
 		 643 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.83 
 
 		 407 aa  55.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 383 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  29.29 
 
 		 391 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.08 
 
 		 646 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  27.52 
 
 		 419 aa  55.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0798  hypothetical protein  35.54 
 
 		 406 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.07 
 
 		 421 aa  54.7  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.76 
 
 		 416 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.06 
 
 		 418 aa  53.9  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 873 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 405 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  30.38 
 
 		 411 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  45.56 
 
 		 403 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 405 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  32.47 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2755  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.68 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 862 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 853 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.14 
 
 		 416 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.68 
 
 		 417 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>