224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1964 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 643 aa  1185    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  43.96 
 
 		 638 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  33.77 
 
 		 841 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 848 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.41 
 
 		 863 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  28.2 
 
 		 854 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.28 
 
 		 843 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.13 
 
 		 807 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  31.01 
 
 		 852 aa  97.8  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 		 855 aa  97.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 856 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.36 
 
 		 842 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.44 
 
 		 855 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 859 aa  92  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 852 aa  91.3  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 873 aa  90.1  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.89 
 
 		 861 aa  90.1  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 828 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 878 aa  87.4  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 		 852 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  30.39 
 
 		 845 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.1 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.41 
 
 		 821 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  27.31 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.55 
 
 		 849 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  39.87 
 
 		 871 aa  76.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 		 861 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.37 
 
 		 859 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 		 930 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  34.87 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.11 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.71 
 
 		 849 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.95 
 
 		 836 aa  67.4  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.5 
 
 		 841 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 838 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 822 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 874 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 873 aa  64.3  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.67 
 
 		 825 aa  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  33.19 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 		 834 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.11 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  31.23 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 		 822 aa  61.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  20.37 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 897 aa  60.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 846 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  35.81 
 
 		 858 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.15 
 
 		 857 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  38.43 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  41.24 
 
 		 867 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0268  ABC-type transport system, permease component  38.76 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.1 
 
 		 858 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 		 806 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  31.15 
 
 		 397 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  43.66 
 
 		 801 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 849 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  47.46 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 857 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  36.51 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 		 847 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  33.1 
 
 		 849 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  35.58 
 
 		 379 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  37.39 
 
 		 399 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.37 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  26.92 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1175  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.22 
 
 		 416 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.08 
 
 		 414 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.98 
 
 		 418 aa  51.6  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  26.7 
 
 		 649 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.6 
 
 		 419 aa  51.2  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  35.97 
 
 		 787 aa  51.2  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  26.71 
 
 		 649 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  30.66 
 
 		 430 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 430 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  40.48 
 
 		 850 aa  50.8  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 649 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  30.77 
 
 		 444 aa  50.4  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.06 
 
 		 422 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.56 
 
 		 411 aa  50.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.06 
 
 		 422 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  37.23 
 
 		 488 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.77 
 
 		 408 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  26.7 
 
 		 649 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.63 
 
 		 414 aa  50.4  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  30.63 
 
 		 414 aa  50.4  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.09 
 
 		 851 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.64 
 
 		 418 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.06 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  28.05 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>