More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1875 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
878 aa  1735    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  42.7 
 
 
859 aa  513  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
871 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  37.67 
 
 
857 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  38.16 
 
 
855 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  34.53 
 
 
880 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 
897 aa  313  9e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 
846 aa  302  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 
846 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  33.3 
 
 
836 aa  270  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.06 
 
 
835 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.37 
 
 
841 aa  263  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
930 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.09 
 
 
838 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
855 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.51 
 
 
825 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 
861 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.29 
 
 
853 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.54 
 
 
845 aa  183  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.65 
 
 
847 aa  179  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 
852 aa  172  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.47 
 
 
854 aa  171  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  33.39 
 
 
839 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.9 
 
 
821 aa  159  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  31.31 
 
 
848 aa  155  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
856 aa  147  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  28.24 
 
 
828 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.9 
 
 
738 aa  144  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  31.13 
 
 
843 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 
873 aa  137  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
826 aa  124  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
859 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 
834 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  33.33 
 
 
842 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.97 
 
 
849 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.65 
 
 
858 aa  107  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  28.23 
 
 
861 aa  101  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  29.8 
 
 
849 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  34.98 
 
 
853 aa  91.3  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.19 
 
 
855 aa  90.9  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.06 
 
 
857 aa  88.6  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 
806 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 
488 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  33.56 
 
 
866 aa  85.1  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.98 
 
 
857 aa  84  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  30.26 
 
 
854 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.57 
 
 
863 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  28.98 
 
 
853 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  24.5 
 
 
850 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 
801 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  24.5 
 
 
794 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.76 
 
 
856 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.49 
 
 
850 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.51 
 
 
684 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.72 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  30 
 
 
896 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.12 
 
 
873 aa  70.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 
822 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.9 
 
 
858 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.16 
 
 
829 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.01 
 
 
855 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  29.96 
 
 
855 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.47 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.47 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  28.47 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  28.47 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  28.47 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.06 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  28.47 
 
 
383 aa  66.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.88 
 
 
411 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.82 
 
 
829 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.65 
 
 
414 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.58 
 
 
850 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 
452 aa  65.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.46 
 
 
414 aa  65.1  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 
443 aa  65.1  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.98 
 
 
397 aa  65.1  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.79 
 
 
664 aa  64.7  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  33.81 
 
 
431 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.83 
 
 
413 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  28.21 
 
 
394 aa  64.3  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  40.46 
 
 
643 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.46 
 
 
397 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.08 
 
 
367 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.63 
 
 
406 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
379 aa  62.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
413 aa  62  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
415 aa  62.4  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  25.43 
 
 
849 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.65 
 
 
423 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.5 
 
 
437 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.09 
 
 
419 aa  62  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
457 aa  61.6  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  25.34 
 
 
885 aa  61.6  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 
833 aa  61.6  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.46 
 
 
390 aa  61.6  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>