More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2698 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 855 aa  1692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  56.37 
 
 		 854 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.94 
 
 		 863 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  30.48 
 
 		 852 aa  323  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.81 
 
 		 807 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  30.11 
 
 		 838 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 828 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 822 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 		 874 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 		 822 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  31.02 
 
 		 841 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  28.35 
 
 		 823 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 867 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.6 
 
 		 843 aa  150  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 838 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  25.15 
 
 		 845 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 848 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 822 aa  141  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.93 
 
 		 847 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 852 aa  139  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.25 
 
 		 842 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 852 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.13 
 
 		 821 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.57 
 
 		 854 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 834 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 853 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  34.87 
 
 		 445 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 648 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.21 
 
 		 836 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 		 873 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  24.91 
 
 		 849 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 		 930 aa  101  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.31 
 
 		 859 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 856 aa  99.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 855 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 838 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.18 
 
 		 841 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  24.66 
 
 		 849 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 861 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 		 449 aa  88.6  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 859 aa  87.8  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.55 
 
 		 851 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.6 
 
 		 858 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 839 aa  84.7  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.54 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.52 
 
 		 857 aa  84  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.19 
 
 		 880 aa  83.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  28.73 
 
 		 861 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.5 
 
 		 825 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.83 
 
 		 858 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  23.46 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 866 aa  75.5  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 853 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.72 
 
 		 855 aa  74.7  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.75 
 
 		 850 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 		 897 aa  70.5  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.1 
 
 		 849 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.96 
 
 		 878 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  22.21 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.84 
 
 		 850 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 638 aa  63.9  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 386 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.02 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  33.54 
 
 		 857 aa  62  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  24.75 
 
 		 857 aa  62  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.28 
 
 		 835 aa  62  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  28.09 
 
 		 828 aa  62  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 		 871 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 853 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.52 
 
 		 380 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  22 
 
 		 870 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.61 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.14 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  27.34 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  25.27 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 857 aa  57.4  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 385 aa  57.4  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  31.25 
 
 		 444 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  36.07 
 
 		 849 aa  57  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.67 
 
 		 408 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.87 
 
 		 400 aa  57  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  20.32 
 
 		 794 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.06 
 
 		 386 aa  57  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  28.38 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  25.17 
 
 		 868 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.71 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 847 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.68 
 
 		 423 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.44 
 
 		 386 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 873 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>