61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2456 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
627 aa  1133    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  42.28 
 
 
648 aa  330  4e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  45.54 
 
 
640 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  36.04 
 
 
863 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  34.41 
 
 
852 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 
822 aa  163  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  33.92 
 
 
874 aa  137  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  29.12 
 
 
854 aa  134  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 
855 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  32.25 
 
 
838 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
822 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.42 
 
 
807 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.64 
 
 
841 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.74 
 
 
848 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  31.37 
 
 
823 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.4 
 
 
841 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  29.36 
 
 
845 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.02 
 
 
843 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  41.61 
 
 
445 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 
838 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 
856 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.61 
 
 
836 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.19 
 
 
842 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
873 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
834 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
855 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.27 
 
 
859 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 
861 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  43.48 
 
 
867 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  33.83 
 
 
822 aa  57.4  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  25.35 
 
 
896 aa  57.4  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.41 
 
 
825 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.56 
 
 
847 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  37 
 
 
828 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.75 
 
 
821 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  39.08 
 
 
866 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
833 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 
930 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
878 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 
806 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 
853 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0909  hypothetical protein  36.11 
 
 
813 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  41.38 
 
 
853 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  38.82 
 
 
855 aa  48.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  48.44 
 
 
846 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  26.54 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.81 
 
 
362 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  31.76 
 
 
856 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  25.5 
 
 
414 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  37.93 
 
 
405 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
386 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.82 
 
 
880 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
638 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
897 aa  44.3  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  26.28 
 
 
868 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  36.76 
 
 
858 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  31.08 
 
 
829 aa  44.3  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  35.42 
 
 
410 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 
404 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  35.42 
 
 
411 aa  43.9  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>