More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1850 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
444 aa  905    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3937  hypothetical protein  27.53 
 
 
435 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4079  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4046  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0497  hypothetical protein  25.82 
 
 
435 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  26.05 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  23.41 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.28 
 
 
847 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.47 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  20.04 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  25.22 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.13 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  19.79 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  21.83 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  22.05 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.38 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  20 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  24.34 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 
871 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  20.21 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.06 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  30.11 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  20.05 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  22.51 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  19.28 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  22.27 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  24.83 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  50 
 
 
438 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  30.87 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  19.96 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  20.39 
 
 
414 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.97 
 
 
397 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  29.38 
 
 
421 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.67 
 
 
408 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  22.39 
 
 
410 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  34.75 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  32.31 
 
 
393 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1851  ABC transporter, permease protein, putative  37.18 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00637092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.22 
 
 
850 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  28.08 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.45 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  23.75 
 
 
794 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.17 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  46.48 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  24.72 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.68 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  21.28 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.45 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  31.88 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.12 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.49 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  21.45 
 
 
419 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.62 
 
 
859 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.13 
 
 
397 aa  57  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  28.86 
 
 
396 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  20.81 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
386 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  31.97 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.12 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 
855 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2169  protein of unknown function DUF214  32.64 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  38.96 
 
 
856 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
430 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  42.65 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
475 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  30.13 
 
 
716 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.05 
 
 
885 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 
853 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
897 aa  55.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 
846 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.05 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 
475 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  21.11 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
410 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.32 
 
 
421 aa  54.7  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.12 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
475 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 
404 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
475 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.84 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  20.83 
 
 
412 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
475 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>