132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2246 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  100 
 
 
838 aa  1622    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  42.36 
 
 
874 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  41.08 
 
 
823 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  34.69 
 
 
863 aa  356  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  40.15 
 
 
822 aa  342  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  32.43 
 
 
852 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  31.05 
 
 
854 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  30.55 
 
 
855 aa  291  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  35.17 
 
 
822 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
822 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.83 
 
 
807 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
828 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  29.5 
 
 
648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  28.53 
 
 
841 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.11 
 
 
640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.03 
 
 
841 aa  107  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.16 
 
 
842 aa  107  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.04 
 
 
843 aa  101  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  33.44 
 
 
867 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  31.77 
 
 
627 aa  92.8  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 
866 aa  88.6  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 
853 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.99 
 
 
848 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.21 
 
 
845 aa  85.1  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 
873 aa  85.1  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.9 
 
 
836 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  34.24 
 
 
861 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 
834 aa  81.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.44 
 
 
821 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 
855 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
859 aa  76.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
857 aa  74.3  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.31 
 
 
847 aa  72.8  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.72 
 
 
858 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 
930 aa  70.5  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.02 
 
 
849 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.46 
 
 
857 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 
852 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 
853 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
856 aa  65.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 
833 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 
838 aa  64.3  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.4 
 
 
855 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  30.92 
 
 
851 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.62 
 
 
850 aa  61.6  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  22.32 
 
 
897 aa  60.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  26.62 
 
 
854 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
806 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 
873 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  40.96 
 
 
445 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  28.99 
 
 
849 aa  56.2  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 
861 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.94 
 
 
825 aa  54.3  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  24.2 
 
 
362 aa  53.9  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  24.29 
 
 
395 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 
400 aa  53.5  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 
839 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  23.95 
 
 
788 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
857 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.47 
 
 
855 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 
849 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  22.01 
 
 
896 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  21.48 
 
 
779 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 
849 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.88 
 
 
382 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.84 
 
 
846 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  25.35 
 
 
410 aa  51.2  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 
847 aa  51.2  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  28.24 
 
 
787 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.19 
 
 
414 aa  50.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 
414 aa  50.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  21.71 
 
 
779 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.77 
 
 
376 aa  49.3  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  22.61 
 
 
828 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  29.19 
 
 
862 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1094  protein of unknown function DUF214  35.9 
 
 
969 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  35.14 
 
 
408 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.89 
 
 
386 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.5 
 
 
417 aa  48.5  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  36.75 
 
 
404 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 
801 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.98 
 
 
835 aa  48.5  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  21.65 
 
 
640 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.23 
 
 
855 aa  47.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  28.29 
 
 
851 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.55 
 
 
397 aa  47.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.46 
 
 
871 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.57 
 
 
662 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.5 
 
 
386 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.14 
 
 
408 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  23.61 
 
 
829 aa  47.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  20.94 
 
 
640 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
462 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  29.77 
 
 
926 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.27 
 
 
411 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  23.4 
 
 
637 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.2 
 
 
859 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 
796 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
831 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 
878 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>