31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1915 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 449 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  36.36 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  33.8 
 
 		 854 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 		 855 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  29.41 
 
 		 852 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.87 
 
 		 807 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.54 
 
 		 863 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 		 648 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 		 848 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  31.96 
 
 		 822 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 		 874 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.78 
 
 		 845 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 822 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 828 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.31 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  36.96 
 
 		 638 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  29.05 
 
 		 838 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  31.65 
 
 		 836 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 867 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  43.33 
 
 		 851 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  37.7 
 
 		 871 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 703 aa  45.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  50 
 
 		 855 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  37.1 
 
 		 861 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.14 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  32.61 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  30.83 
 
 		 842 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  40.98 
 
 		 834 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 		 833 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  42.55 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>