More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0890 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 
502 aa  1005    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  38.94 
 
 
443 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  32.94 
 
 
452 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3172  hypothetical protein  31.37 
 
 
471 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.534068  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
457 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3702  hypothetical protein  28.6 
 
 
449 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.962253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  39.73 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  24.95 
 
 
431 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  34.26 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 
419 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  38.71 
 
 
387 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  31.22 
 
 
403 aa  90.1  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.42 
 
 
656 aa  90.1  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.37 
 
 
658 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.64 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  30.21 
 
 
411 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  31.94 
 
 
413 aa  87.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  29.92 
 
 
394 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 
403 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  44.9 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.46 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  33.7 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  42.74 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.05 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.19 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  31.96 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.2 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  30.74 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  30.74 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  30.74 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  31.72 
 
 
649 aa  83.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  30.3 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  30.69 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.04 
 
 
653 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.12 
 
 
653 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  29.44 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  37.82 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  29.02 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  36.22 
 
 
645 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  40.46 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  31.08 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  49.43 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  38.84 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.05 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.65 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.05 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  30.05 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.12 
 
 
648 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.12 
 
 
648 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.34 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  49.43 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  39.53 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  32.22 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  32.22 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.7 
 
 
646 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  28.12 
 
 
383 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.77 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.51 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.29 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  32.22 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.22 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.22 
 
 
648 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.22 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.95 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  39.67 
 
 
381 aa  80.1  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.58 
 
 
682 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  33.54 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  29.03 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  30.14 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  26.88 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  46.07 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  38.46 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.58 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  31.98 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.58 
 
 
667 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  29.21 
 
 
401 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.58 
 
 
682 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.05 
 
 
656 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  46.07 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  45.36 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.8 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  39.06 
 
 
656 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  28.44 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.05 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.4 
 
 
696 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.22 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.67 
 
 
648 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  40 
 
 
643 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  40.16 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  32.42 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  35.25 
 
 
430 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.59 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  36.84 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.53 
 
 
656 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>