More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1059 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  791    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  67.33 
 
 
400 aa  559  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  67.08 
 
 
407 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  68.08 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  53.62 
 
 
384 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  52.36 
 
 
401 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  36.54 
 
 
373 aa  192  9e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  36.05 
 
 
373 aa  192  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  32.55 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  32.04 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  28.24 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.82 
 
 
390 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.66 
 
 
387 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  22.57 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.91 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.43 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  28.23 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.71 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.99 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.32 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.79 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.81 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  23.4 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  30.84 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.1 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.64 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.99 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.12 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  34.78 
 
 
502 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  21.48 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.8 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  27.73 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.29 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.79 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.68 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  27.45 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.83 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  24.77 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  23.08 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.4 
 
 
662 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.65 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.73 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.6 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  23.19 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.3 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  26.63 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.49 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  24.92 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.17 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.04 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  35.47 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  24.31 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  34.68 
 
 
660 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  25.88 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.89 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.33 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.83 
 
 
855 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.62 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.46 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  30.46 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  22.5 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.95 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  24.41 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  30.65 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  31.37 
 
 
779 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  25.12 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  31.95 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  33.68 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.72 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.91 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  28.1 
 
 
653 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.04 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.26 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  21.55 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.24 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  28.1 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  26.11 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  23.33 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  26.94 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  28.43 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  20.58 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>