More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0653 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  796    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  66.09 
 
 		 400 aa  547  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  67.73 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  66.58 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  58.23 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  52.09 
 
 		 384 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  37.38 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  34.55 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  35.28 
 
 		 373 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  32.06 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  29.02 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  22.93 
 
 		 367 aa  94  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.14 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.69 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.46 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.41 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.17 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1742  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  24.77 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.54 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.71 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.46 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.42 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.66 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  25.23 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.26 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.07 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.28 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.15 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.18 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.8 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.26 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.16 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0746  putative ABC transport system permease protein  22.46 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.489511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.99 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.78 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.32 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  26.27 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.01 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  25.48 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  28.05 
 
 		 858 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.71 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.27 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.82 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  36.42 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  25.23 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  26.59 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  24.09 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  26.88 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.24 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  22.78 
 
 		 842 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  26.01 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.73 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  22.86 
 
 		 843 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.17 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  22.95 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  21.65 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.1 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  24.88 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.24 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  21.85 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  20.57 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  34.46 
 
 		 660 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.57 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.33 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.65 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  20.75 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  33.98 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.64 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.02 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.22 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.47 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1441  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0689519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.24 
 
 		 855 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  27.88 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  24.27 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.87 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>