More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1006 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  789    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  57.49 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  51.64 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  53.4 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  52.36 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  52.43 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1012  hypothetical protein  38.07 
 
 		 373 aa  201  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.976077  hitchhiker  0.00121188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0080  hypothetical protein  38.32 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  34.19 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1403  hypothetical protein  29.5 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  28.13 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.22 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.68 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.51 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.44 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  23.27 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1742  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.02 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  22.88 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.94 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 852 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.35 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  34.25 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  30.05 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  26.26 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.46 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  24.82 
 
 		 654 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  23.06 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  24.21 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.19 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.79 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.25 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  30.93 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  26.98 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.78 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.93 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  27.48 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  24.71 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  33.97 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  22.65 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  26.36 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.28 
 
 		 643 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  23.47 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.95 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.24 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.71 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  27.3 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  24.88 
 
 		 855 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 848 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  31.62 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.88 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  28.23 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  31.62 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.46 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  27.42 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.53 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.91 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.75 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  27.69 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.95 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  23.25 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  38.6 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2147  hypothetical protein  25.59 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0010107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  29.61 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  33.81 
 
 		 651 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  20.91 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  23.39 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  33.57 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  27.13 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  27.6 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.64 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  29.61 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  30.63 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  23.11 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>