More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3335 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 463 aa  927    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  58.19 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  40.9 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  41.54 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  41.08 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  39.78 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  36.52 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.28 
 
 		 409 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  29.7 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  31.09 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.14 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.33 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  26.41 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.81 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 406 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.08 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.21 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.34 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  28.97 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 		 421 aa  153  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.51 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  31.1 
 
 		 405 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 404 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.59 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.8 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  28.63 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  28.75 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  27.66 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.72 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.65 
 
 		 410 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  35.79 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.41 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.41 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  28.73 
 
 		 405 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 406 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 		 406 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  28.72 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 406 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  27.91 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.77 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 403 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.81 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  26.5 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  28.72 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  27.66 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  29.15 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  26.67 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  27.78 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.6 
 
 		 653 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  26.83 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  29.11 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  34.04 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  29.65 
 
 		 641 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  28.54 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  24.95 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.62 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.51 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  27.56 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  26.09 
 
 		 652 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  29.44 
 
 		 641 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.03 
 
 		 641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  28.79 
 
 		 668 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.77 
 
 		 417 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  26.94 
 
 		 643 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.11 
 
 		 658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.79 
 
 		 656 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  27.25 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.49 
 
 		 641 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  25.43 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  33.68 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.98 
 
 		 411 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.49 
 
 		 646 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.15 
 
 		 667 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.15 
 
 		 667 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  26.64 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.15 
 
 		 682 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.15 
 
 		 682 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.59 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  28.42 
 
 		 408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0954  hypothetical protein  25.81 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.09 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  25.7 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  26.08 
 
 		 668 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>