More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1553 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  776    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  77.2 
 
 		 386 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  76.17 
 
 		 386 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  77.98 
 
 		 386 aa  591  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  77.72 
 
 		 386 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  76.17 
 
 		 386 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  58.29 
 
 		 386 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  47.67 
 
 		 385 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  41.39 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  36.75 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  33.94 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  36.4 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  39.56 
 
 		 462 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.41 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  26.32 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  26.33 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.39 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.86 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  25.6 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.3 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  23.42 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.11 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.52 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  24.2 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23.6 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.81 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 420 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  23.58 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.77 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.63 
 
 		 371 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.16 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  25.63 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  23.24 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.46 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 		 429 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.84 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.21 
 
 		 434 aa  93.2  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.09 
 
 		 855 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  22.62 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.57 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  26.14 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  26.65 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.73 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  23.67 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.46 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.88 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  22.71 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  25.96 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.48 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.54 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  23.13 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.06 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.2 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.18 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.2 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  26.02 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  26.33 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  24.94 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  24.35 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  24.1 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.97 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.27 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  23.96 
 
 		 696 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  23.49 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.14 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.38 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.18 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.94 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.54 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.49 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  20.97 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  26.52 
 
 		 646 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.36 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  25.25 
 
 		 644 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.96 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.27 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>