More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3643 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  95.34 
 
 		 386 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  778    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  89.9 
 
 		 386 aa  712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  89.12 
 
 		 386 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  77.98 
 
 		 386 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  74.87 
 
 		 386 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  55.96 
 
 		 386 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  46.89 
 
 		 385 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  39.33 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  34.7 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  36.28 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.43 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  26.45 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.67 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.73 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  24.59 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.81 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.71 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.9 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.68 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.92 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  26.91 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  23.44 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  24 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.2 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.07 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.02 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  22.37 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  24.59 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  25.18 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  23.2 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  23.76 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  26.67 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.94 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  23.7 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.95 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  23.64 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.82 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.02 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.33 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.51 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  22.25 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  26.82 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.12 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.46 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.15 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.88 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.07 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  26.77 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23.15 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.72 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.93 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  24.69 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  28.1 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.13 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.69 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  25.24 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  25.24 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  24.15 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  22.17 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.12 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  27.27 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.81 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.36 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.06 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25.12 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.72 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  23.39 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.43 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>