More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1167 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 430 aa  856    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  58.06 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  57.83 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  52.33 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  50.23 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  50.47 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  46.51 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  38.28 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  37.24 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  37.47 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  35.5 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  35.36 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.19 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  32.81 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  36.72 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  31.47 
 
 		 408 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  23.91 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  25.52 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  26.22 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.39 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.39 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  23.66 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  23.72 
 
 		 386 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  23.64 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 371 aa  96.3  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.45 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  21.4 
 
 		 373 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  22.4 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.34 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.32 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.88 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  21.31 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  18.91 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.73 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  21.29 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  22.52 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.52 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  24.04 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  24.44 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  25.11 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.48 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  21.35 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  23.16 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  21.27 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.76 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.03 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.01 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  21.12 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.46 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  20.89 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.79 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  22.85 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30.77 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 834 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 		 848 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  22.48 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.5 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  24.33 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  34.19 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  22.67 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.2 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.12 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  31.91 
 
 		 656 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  31.73 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.88 
 
 		 658 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 873 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.62 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  28.71 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  28.1 
 
 		 1090 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.89 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 714 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  32.69 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  31.36 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.73 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  32.38 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 467 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.12 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>