289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1166 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 371 aa  720    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  60.75 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  61.29 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  44.68 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  43.62 
 
 		 380 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  42.63 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  41.46 
 
 		 376 aa  264  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  36 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  35.2 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  35.83 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  32.54 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  24.53 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  28.47 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.08 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  27.47 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.62 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  26.16 
 
 		 430 aa  106  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  25.23 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 429 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.78 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.63 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  27.52 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.28 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  24.5 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.12 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  30.72 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.38 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.16 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.93 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.77 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.7 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  20.85 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  21.9 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  31.75 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.32 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.55 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  23.84 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.92 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.12 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  29.41 
 
 		 779 aa  57  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  24.07 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  32.35 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  22.66 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.91 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  28.85 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.27 
 
 		 643 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  19.59 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.93 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.97 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  23.04 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.45 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.17 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.32 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  21.99 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.34 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.43 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0426  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolC  21.6 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  26.77 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.23 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 822 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  32.69 
 
 		 405 aa  52.8  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.31 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  22.62 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.89 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  19.62 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  21.27 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  20.57 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.68 
 
 		 809 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.65 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.56 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  25.85 
 
 		 1130 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.79 
 
 		 433 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  32.8 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.47 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  22.58 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>