More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2022 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  98.12 
 
 		 372 aa  709    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  97.85 
 
 		 372 aa  686    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 372 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  61.29 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  45.07 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  44 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  40.11 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  40.11 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  31.5 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  31.4 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  32 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  26.23 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  27.32 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  27.23 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  27.21 
 
 		 430 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.1 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  26.32 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  25.44 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.89 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.61 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.02 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  23.64 
 
 		 425 aa  93.2  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  22.2 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.93 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  26.3 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  22.28 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.37 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.08 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.59 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.69 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  22.52 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  21.09 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  28.97 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.06 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.26 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  19.57 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.38 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  22.33 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.47 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.73 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  21.19 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.15 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.43 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  22.22 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  23.91 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.69 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.81 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  30.61 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.11 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  22.42 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1634  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.55 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0870078  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.57 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 		 952 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  24.13 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.36 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  24.17 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.27 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  24.28 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.99 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  21.04 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  21.01 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  21.18 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.57 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.26 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.35 
 
 		 848 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0426  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolC  23.94 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.55 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  19.8 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.69 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  23.15 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.57 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.79 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  20.06 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  24.22 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.06 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.37 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.63 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>