147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2760 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 822 aa  1527    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  43.42 
 
 		 863 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  42.49 
 
 		 852 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  39.51 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  34.31 
 
 		 854 aa  351  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 855 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  35.04 
 
 		 822 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  34.2 
 
 		 838 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  37.23 
 
 		 874 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  35.06 
 
 		 828 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  34.31 
 
 		 823 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  36.17 
 
 		 822 aa  205  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  32.38 
 
 		 648 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 838 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.83 
 
 		 640 aa  155  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  31.23 
 
 		 841 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 		 852 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  26.67 
 
 		 843 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.79 
 
 		 847 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 		 834 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.31 
 
 		 842 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.3 
 
 		 841 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 852 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 		 848 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.15 
 
 		 845 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 867 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 856 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 861 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.24 
 
 		 821 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 855 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  35.94 
 
 		 627 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.34 
 
 		 861 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.03 
 
 		 854 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 873 aa  101  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 866 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 853 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 801 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 846 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.59 
 
 		 849 aa  93.6  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.01 
 
 		 825 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 838 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.72 
 
 		 849 aa  88.6  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 806 aa  87.8  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 859 aa  85.5  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.4 
 
 		 836 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 855 aa  77.4  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 		 857 aa  72.4  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 		 930 aa  72.4  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 		 853 aa  72.4  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 		 873 aa  71.6  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 853 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.35 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  22.49 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  37.6 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  35.17 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  26.7 
 
 		 787 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 355 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  30.25 
 
 		 855 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.48 
 
 		 857 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  32.52 
 
 		 422 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  26.47 
 
 		 386 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 849 aa  55.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 878 aa  55.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 826 aa  54.3  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  26.96 
 
 		 828 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 643 aa  54.3  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  26.88 
 
 		 805 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.98 
 
 		 386 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.65 
 
 		 835 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 386 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.27 
 
 		 488 aa  52.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.86 
 
 		 850 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 371 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  28.1 
 
 		 408 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  40.57 
 
 		 846 aa  51.6  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.47 
 
 		 885 aa  51.2  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  27.45 
 
 		 386 aa  50.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  28.29 
 
 		 821 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  25.63 
 
 		 392 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  20.7 
 
 		 362 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 		 849 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  28.17 
 
 		 846 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  24.1 
 
 		 402 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  42.65 
 
 		 871 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 386 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  25.68 
 
 		 380 aa  49.3  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1090 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 857 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.16 
 
 		 397 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  27.76 
 
 		 788 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1840  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.22 
 
 		 433 aa  48.5  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  27.02 
 
 		 790 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.36 
 
 		 411 aa  48.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 386 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  31.9 
 
 		 851 aa  47.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  39.68 
 
 		 425 aa  47.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  17.56 
 
 		 856 aa  47.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  28.38 
 
 		 428 aa  47.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>