91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5376 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1533    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  77.92 
 
 		 800 aa  1216    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  39.75 
 
 		 788 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  43.13 
 
 		 787 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  41.67 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  43.06 
 
 		 787 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.86 
 
 		 787 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  41.54 
 
 		 793 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  42.4 
 
 		 793 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 		 789 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  39.85 
 
 		 789 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  39.57 
 
 		 789 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  42.26 
 
 		 788 aa  532  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  41.81 
 
 		 787 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  37.26 
 
 		 787 aa  521  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  39.33 
 
 		 788 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  38.9 
 
 		 787 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  40.45 
 
 		 790 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  38.75 
 
 		 787 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  39.49 
 
 		 786 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  37.91 
 
 		 787 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  40.46 
 
 		 789 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  38.92 
 
 		 788 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  38.17 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  39.72 
 
 		 789 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  42.86 
 
 		 790 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  39.8 
 
 		 787 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  36.99 
 
 		 787 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  37.15 
 
 		 791 aa  466  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  39.67 
 
 		 786 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  38.66 
 
 		 793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  35.61 
 
 		 787 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  38.91 
 
 		 786 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 		 786 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  38.65 
 
 		 786 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  37.5 
 
 		 787 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.94 
 
 		 789 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  31.33 
 
 		 791 aa  365  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.06 
 
 		 792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 792 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 		 792 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  29.24 
 
 		 787 aa  275  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 797 aa  240  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.65 
 
 		 947 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 		 774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  20.52 
 
 		 773 aa  126  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  22.02 
 
 		 1132 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  21.49 
 
 		 1132 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 1177 aa  121  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 1016 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.86 
 
 		 859 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  21.93 
 
 		 759 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1090 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.97 
 
 		 743 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  23.97 
 
 		 868 aa  112  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  21.38 
 
 		 737 aa  94.7  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 1110 aa  93.6  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.14 
 
 		 1068 aa  93.2  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  24.25 
 
 		 1232 aa  92  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 749 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.29 
 
 		 1143 aa  83.2  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.35 
 
 		 917 aa  79.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.1 
 
 		 876 aa  78.2  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  24.97 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.56 
 
 		 1211 aa  63.9  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 355 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.71 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  39.68 
 
 		 833 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  21.7 
 
 		 373 aa  49.7  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  27.78 
 
 		 401 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 772 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.88 
 
 		 821 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 		 855 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 838 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 840 aa  47.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.59 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.61 
 
 		 841 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0511  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1753 aa  46.6  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.665267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 853 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.18 
 
 		 420 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 857 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  23.72 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.58 
 
 		 854 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 837 aa  45.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.43 
 
 		 828 aa  45.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.91 
 
 		 420 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  29 
 
 		 408 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.31 
 
 		 400 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.84 
 
 		 839 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>