68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4404 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 822 aa  1495    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  45.2 
 
 		 874 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  42.79 
 
 		 823 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  40.83 
 
 		 838 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  34.43 
 
 		 863 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  32.33 
 
 		 854 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  32.79 
 
 		 852 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 		 822 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 855 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  33.75 
 
 		 807 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  31.99 
 
 		 828 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  32.83 
 
 		 822 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 648 aa  92.8  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.62 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 		 867 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  32.49 
 
 		 841 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.06 
 
 		 821 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 848 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 855 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 		 866 aa  71.2  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.45 
 
 		 843 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  35.03 
 
 		 627 aa  70.5  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.96 
 
 		 873 aa  70.1  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.31 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 		 853 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 852 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.64 
 
 		 845 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  22.25 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.04 
 
 		 841 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.46 
 
 		 850 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  25 
 
 		 857 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.71 
 
 		 880 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.83 
 
 		 851 aa  55.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  25.74 
 
 		 858 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  44.16 
 
 		 871 aa  54.7  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 		 857 aa  54.3  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 		 806 aa  54.7  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  23.63 
 
 		 380 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  38.28 
 
 		 855 aa  52.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.29 
 
 		 842 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.99 
 
 		 825 aa  51.6  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 		 897 aa  51.2  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  38.1 
 
 		 445 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30.95 
 
 		 861 aa  51.2  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 849 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 878 aa  50.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 849 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.25 
 
 		 380 aa  48.9  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.78 
 
 		 397 aa  48.5  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 859 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 		 839 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  27.38 
 
 		 626 aa  47.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 792 aa  47.8  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7924  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 800 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.54 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  22.51 
 
 		 390 aa  47  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  20.88 
 
 		 376 aa  45.8  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.31 
 
 		 859 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  39.24 
 
 		 846 aa  45.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.38 
 
 		 389 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  25.8 
 
 		 787 aa  45.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 930 aa  45.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  30 
 
 		 821 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 		 842 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23 
 
 		 402 aa  44.3  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  23.37 
 
 		 835 aa  44.3  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 801 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>