28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7924 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7924  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 800 aa  1580    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4389  hypothetical protein  41.85 
 
 		 738 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00620385  normal  0.0763204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0813  hypothetical protein  35.21 
 
 		 742 aa  320  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0525  hypothetical protein  29.08 
 
 		 743 aa  223  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7375  hypothetical protein  31.49 
 
 		 647 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5554  hypothetical protein  34.62 
 
 		 663 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39170  Predicted permease  30.77 
 
 		 745 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.109534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6783  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 786 aa  125  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3843  hypothetical protein  25.16 
 
 		 770 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3474  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 771 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1612  Permease component of hypothetical ABC-type transport system  27.3 
 
 		 482 aa  99.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.982274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02450  Predicted permease  27.63 
 
 		 644 aa  94.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6786  protein of unknown function DUF214  29.66 
 
 		 737 aa  94.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00462962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3126  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 		 449 aa  90.5  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277757  decreased coverage  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3829  protein of unknown function DUF214  29.97 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00630449  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6785  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 786 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0938244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1340  hypothetical protein  26.7 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25570  Predicted permease  30.64 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0303  protein of unknown function DUF214  29.97 
 
 		 761 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07190  Predicted permease  33.19 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.665667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02170  hypothetical protein  32.18 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3777  hypothetical protein  32.27 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0381  hypothetical protein  30.64 
 
 		 638 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0441  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 438 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.990403 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.14 
 
 		 897 aa  46.6  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  28.81 
 
 		 293 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  29.48 
 
 		 855 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2823  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>