More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2644 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  100 
 
 
852 aa  1629    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  46.36 
 
 
863 aa  612  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  42.49 
 
 
822 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  41.07 
 
 
807 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  33.95 
 
 
854 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
855 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  37.37 
 
 
828 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  35.79 
 
 
822 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  32.41 
 
 
838 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 
874 aa  250  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  31.18 
 
 
823 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 
867 aa  201  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 
648 aa  192  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  33 
 
 
822 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
852 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.15 
 
 
841 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.99 
 
 
845 aa  165  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 
838 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.87 
 
 
842 aa  161  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 
853 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
859 aa  145  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.16 
 
 
843 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 
848 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
853 aa  139  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 
834 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
806 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  28.23 
 
 
861 aa  137  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.89 
 
 
847 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.92 
 
 
640 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 
852 aa  134  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.71 
 
 
856 aa  129  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.97 
 
 
854 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 
855 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 
857 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 
873 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
853 aa  114  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 
861 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 
866 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
838 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
839 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
846 aa  108  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  34.44 
 
 
627 aa  107  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.42 
 
 
841 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.5 
 
 
836 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.47 
 
 
849 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.49 
 
 
880 aa  98.2  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
638 aa  94.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
855 aa  92  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  26.24 
 
 
825 aa  91.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 
897 aa  91.7  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.44 
 
 
855 aa  91.3  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.99 
 
 
849 aa  89.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.94 
 
 
821 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  25.72 
 
 
835 aa  86.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  33.46 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.42 
 
 
857 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.11 
 
 
829 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.11 
 
 
829 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.41 
 
 
855 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 
835 aa  73.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.13 
 
 
858 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  30.44 
 
 
643 aa  72.8  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.5 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.66 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25.39 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 
449 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.72 
 
 
850 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  30.52 
 
 
828 aa  66.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 
878 aa  65.5  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 
930 aa  65.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.29 
 
 
399 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.14 
 
 
393 aa  63.9  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  29.63 
 
 
383 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  21.96 
 
 
421 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05800  hypothetical protein  26.47 
 
 
818 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
801 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 
873 aa  61.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  25.82 
 
 
818 aa  61.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.16 
 
 
419 aa  60.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25 
 
 
371 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  26 
 
 
846 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0078  hypothetical protein  21.67 
 
 
410 aa  60.1  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.46 
 
 
389 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
839 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.46 
 
 
871 aa  58.9  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  22.52 
 
 
851 aa  59.7  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.17 
 
 
809 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  22.6 
 
 
868 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.91 
 
 
791 aa  58.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  22.53 
 
 
419 aa  58.9  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.36 
 
 
391 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  20 
 
 
400 aa  58.5  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  25.48 
 
 
416 aa  58.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
410 aa  57.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1229  hypothetical protein  22.07 
 
 
409 aa  57  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.965608  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  22.47 
 
 
392 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  21.02 
 
 
684 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  22.47 
 
 
392 aa  57  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0127  LolC/E family lipoprotein releasing system transmembrane protein  20.69 
 
 
410 aa  57.4  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>