156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3777 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  28.87 
 
 
378 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
378 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  28.34 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  27.94 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  27.59 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  30.57 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  25.73 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  25.74 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.91 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  25.4 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  26.36 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  24.61 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  28.89 
 
 
852 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
866 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 
834 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.13 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  22.1 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  20.74 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
853 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.47 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  22.31 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  22.31 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.08 
 
 
845 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  28.01 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  22.35 
 
 
348 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  30.19 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  26.33 
 
 
349 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  23.41 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  22.46 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
838 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  29.67 
 
 
643 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  21.4 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0999  protein of unknown function DUF214  35.35 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00052376  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.57 
 
 
863 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  28.57 
 
 
779 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  20.98 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.52 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  25.06 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  21.43 
 
 
414 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  21.79 
 
 
415 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  26.27 
 
 
405 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  25.07 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.62 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  22.86 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
452 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  22.77 
 
 
400 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  23.69 
 
 
397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  23.45 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  32.17 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  27.07 
 
 
779 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.44 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.17 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  24.23 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.36 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.11 
 
 
397 aa  49.7  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.49 
 
 
417 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  20.74 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.61 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  23.53 
 
 
885 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  27.23 
 
 
787 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.5 
 
 
919 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  28.19 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.64 
 
 
842 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  28.33 
 
 
903 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
822 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.65 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.74 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
848 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  21.72 
 
 
394 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  21.35 
 
 
835 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 
443 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  22.9 
 
 
1090 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.48 
 
 
893 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.03 
 
 
406 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  26.64 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.75 
 
 
809 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.63 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  24.47 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  19.65 
 
 
390 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>