210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4458 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 822 aa  1579    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  37.04 
 
 		 863 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  35.37 
 
 		 852 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  36.96 
 
 		 807 aa  353  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  35.33 
 
 		 822 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  32.3 
 
 		 854 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  35.95 
 
 		 828 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  28.41 
 
 		 855 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  32.1 
 
 		 838 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 874 aa  205  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  29.98 
 
 		 823 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.82 
 
 		 841 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.11 
 
 		 843 aa  160  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 838 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 		 852 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 648 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.66 
 
 		 847 aa  135  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  33.38 
 
 		 822 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 853 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 852 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  26.04 
 
 		 845 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 834 aa  121  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 		 861 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 848 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.73 
 
 		 640 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  29.28 
 
 		 836 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.32 
 
 		 842 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 		 855 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 859 aa  101  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 		 867 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  27.91 
 
 		 841 aa  99  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 856 aa  93.6  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.61 
 
 		 825 aa  88.2  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 		 866 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.71 
 
 		 854 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  24.76 
 
 		 861 aa  82.4  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  26.64 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  27.44 
 
 		 849 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 855 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.72 
 
 		 858 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  38.52 
 
 		 627 aa  69.7  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.39 
 
 		 851 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.09 
 
 		 857 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  34.07 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.9 
 
 		 849 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 873 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  28.7 
 
 		 821 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  24.57 
 
 		 829 aa  59.7  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  17.77 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.87 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  22.85 
 
 		 855 aa  57  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  35.2 
 
 		 650 aa  57.4  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 930 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.11 
 
 		 880 aa  55.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  28.34 
 
 		 684 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  28.65 
 
 		 897 aa  55.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 		 449 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 		 378 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 443 aa  55.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 397 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  28.93 
 
 		 422 aa  54.3  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  29.46 
 
 		 390 aa  53.9  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  30.58 
 
 		 422 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  31.06 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 		 801 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 386 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 430 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 846 aa  53.5  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  24.47 
 
 		 422 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.98 
 
 		 387 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  36 
 
 		 871 aa  52.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 		 775 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.6 
 
 		 646 aa  52.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  29.23 
 
 		 397 aa  52  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  31.91 
 
 		 395 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.6 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  22.58 
 
 		 829 aa  52  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 838 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  28.46 
 
 		 649 aa  52  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32 
 
 		 648 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32 
 
 		 648 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  22.58 
 
 		 829 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  27.72 
 
 		 404 aa  51.6  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 376 aa  51.6  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.92 
 
 		 885 aa  51.6  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.16 
 
 		 393 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  32.28 
 
 		 656 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>