167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0693 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
828 aa  1610    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  51.06 
 
 
807 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  36.32 
 
 
852 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  32.35 
 
 
854 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  33.93 
 
 
863 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  36.37 
 
 
822 aa  297  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 
855 aa  290  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 
822 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  29.81 
 
 
838 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  30.63 
 
 
841 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 
874 aa  183  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 
838 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0269  hypothetical protein  32.89 
 
 
823 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
853 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 
867 aa  163  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
848 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.43 
 
 
847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  28.88 
 
 
843 aa  148  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 
834 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4404  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
822 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  28.91 
 
 
845 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
852 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.88 
 
 
842 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.22 
 
 
841 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2720  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
648 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
856 aa  120  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
861 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 
852 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
853 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 
855 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
839 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
873 aa  102  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  25.52 
 
 
854 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.81 
 
 
836 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  27.1 
 
 
853 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
838 aa  97.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  29.8 
 
 
861 aa  96.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
859 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.68 
 
 
825 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
857 aa  91.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 
866 aa  91.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.2 
 
 
849 aa  89.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.74 
 
 
835 aa  89  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.53 
 
 
849 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  34.45 
 
 
806 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.23 
 
 
850 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
930 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  34.84 
 
 
445 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.12 
 
 
851 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.47 
 
 
855 aa  76.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.69 
 
 
640 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.983976  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 
897 aa  72.8  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2456  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
627 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0496014  hitchhiker  0.00000468222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  25.74 
 
 
821 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1915  protein of unknown function DUF214  30.74 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.88 
 
 
858 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 
855 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
878 aa  64.3  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  27.1 
 
 
828 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1964  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
643 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
638 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  25.14 
 
 
662 aa  60.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 
801 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  21.32 
 
 
854 aa  56.2  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 
430 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.96 
 
 
430 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.63 
 
 
880 aa  57  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.47 
 
 
417 aa  55.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.81 
 
 
413 aa  54.7  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  34.92 
 
 
1090 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
457 aa  54.3  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  39.2 
 
 
846 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  23.13 
 
 
856 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 
833 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.51 
 
 
829 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.51 
 
 
829 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.41 
 
 
381 aa  52.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  30.63 
 
 
395 aa  52.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 
410 aa  52.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 
386 aa  52.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.78 
 
 
390 aa  52  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  28.57 
 
 
399 aa  52  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 
835 aa  52  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.7 
 
 
857 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3344  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.02 
 
 
415 aa  51.6  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.56 
 
 
643 aa  51.6  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  23.48 
 
 
414 aa  51.2  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.22 
 
 
397 aa  51.6  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.57 
 
 
415 aa  51.2  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  22.02 
 
 
430 aa  51.2  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  32.8 
 
 
399 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
873 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  30.05 
 
 
787 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.68 
 
 
415 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  20.51 
 
 
684 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
408 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.95 
 
 
649 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.55 
 
 
396 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.52 
 
 
409 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.71 
 
 
411 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>